221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4824 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  100 
 
 		 413 aa  788    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  69.29 
 
 		 401 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.44 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  43.98 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  46.3 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  45.68 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  45.68 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  41.16 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  45.37 
 
 		 399 aa  259  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  41.11 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  39.16 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  40.67 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  39.78 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  41.04 
 
 		 405 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  39.74 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  45.43 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  38.15 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  41.76 
 
 		 394 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  41.03 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.42 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  41.76 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  40.8 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  41.51 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  42.93 
 
 		 394 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  42.67 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  42.67 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  41.6 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  35.66 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  37.79 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.65 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  35.58 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  35.17 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  35.17 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  32.96 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  35.17 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  35.17 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  34.86 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  32.96 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  32.96 
 
 		 416 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  32.68 
 
 		 416 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.08 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  32.96 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  34.86 
 
 		 414 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  34.56 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  33.33 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  36.21 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  33.9 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  35.13 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  35.35 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  33.14 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.89 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.94 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  33.14 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  33.66 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  32.86 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  32.86 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  33.14 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  32.86 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  33.66 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  27.91 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  34.02 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  30.7 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  29.98 
 
 		 411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.53 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.03 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  28.87 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.87 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  28.87 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  31.76 
 
 		 406 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  31.31 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  29.33 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  29.33 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  29.33 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  31.49 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  29.18 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1495  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.26 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  28.93 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.12 
 
 		 409 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  31.06 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  31.04 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  27.91 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  27.27 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  27.91 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  27.91 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.27 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  29.1 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  23.44 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  31.41 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  29.71 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  27.64 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.59 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.17 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>