More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4058 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  100 
 
 
413 aa  844    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  56.72 
 
 
409 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  56.37 
 
 
411 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  53.43 
 
 
432 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  52.46 
 
 
409 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  47.41 
 
 
406 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  49.63 
 
 
415 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  40.05 
 
 
409 aa  323  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.98 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  34.68 
 
 
407 aa  235  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  34.17 
 
 
428 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  31.92 
 
 
423 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  29.68 
 
 
426 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  30.33 
 
 
427 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  29.68 
 
 
426 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  29.66 
 
 
427 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  29.66 
 
 
427 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  29.56 
 
 
427 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  29.43 
 
 
426 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  29.43 
 
 
426 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  29.33 
 
 
426 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  30.83 
 
 
422 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  29.41 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.41 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  29.31 
 
 
431 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  29.41 
 
 
427 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  32.38 
 
 
423 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  29.82 
 
 
427 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  31.85 
 
 
430 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  31.85 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  31.65 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  30.05 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  30.05 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  30.05 
 
 
432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  31.92 
 
 
440 aa  183  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  29.71 
 
 
425 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  31.44 
 
 
422 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  32.4 
 
 
432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  27.11 
 
 
425 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  27.94 
 
 
420 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  27.94 
 
 
420 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  30.46 
 
 
432 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  28.74 
 
 
425 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  28.71 
 
 
433 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  30.83 
 
 
426 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  27.14 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  31.62 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  30.25 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  27.16 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  29.74 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  29.5 
 
 
425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  29.98 
 
 
426 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  29.5 
 
 
429 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.8 
 
 
413 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  31.76 
 
 
427 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  29.5 
 
 
423 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  30.6 
 
 
425 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  30.46 
 
 
425 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  32.04 
 
 
400 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  30.92 
 
 
432 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  29.5 
 
 
425 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  29.88 
 
 
425 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  30.22 
 
 
431 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.78 
 
 
424 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  29.79 
 
 
429 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.2 
 
 
413 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.49 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.29 
 
 
413 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.29 
 
 
413 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  30.79 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.29 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.23 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.49 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.71 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.95 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.71 
 
 
417 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.85 
 
 
413 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  28.5 
 
 
423 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  30.83 
 
 
425 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  25.55 
 
 
410 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.56 
 
 
413 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  28.27 
 
 
417 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  30.3 
 
 
398 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  28.25 
 
 
423 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  27.3 
 
 
412 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  28.19 
 
 
418 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  27.68 
 
 
429 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  27.5 
 
 
432 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  28.46 
 
 
418 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  28.46 
 
 
418 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  28.46 
 
 
418 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  30.23 
 
 
424 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  24.68 
 
 
418 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  28.46 
 
 
418 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  28.46 
 
 
418 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  28.46 
 
 
418 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  27.3 
 
 
412 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  29.98 
 
 
397 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  31.51 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>