217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2101 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  100 
 
 		 399 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  51.14 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  45.95 
 
 		 400 aa  312  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  44.24 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  44.73 
 
 		 399 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  44.22 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  44.22 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  43.98 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  42.36 
 
 		 401 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  43.49 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  39.9 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  46.65 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  39.63 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  40.61 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  40.66 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  40.91 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.51 
 
 		 399 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  43.7 
 
 		 399 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  40.66 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  41.09 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  41.67 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  39.59 
 
 		 397 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  41.41 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  41.41 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  43.98 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  41.16 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  42.33 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  40.76 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.78 
 
 		 376 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  38.21 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.59 
 
 		 410 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.06 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.62 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  35.88 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  33.8 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  33.8 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  33.52 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  33.52 
 
 		 421 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  33.8 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  33.33 
 
 		 413 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  33.24 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  33.69 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  33.33 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  33.14 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  33.06 
 
 		 416 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  32.86 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  32.86 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  32.86 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  34.4 
 
 		 464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  33.24 
 
 		 462 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  29.82 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  34.67 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  32.39 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  31.83 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  31.83 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  31.55 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  31.55 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  31.55 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  31.55 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  31.55 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  31.27 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  34.18 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  30.68 
 
 		 445 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  31.86 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  29.05 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  30.87 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  30.46 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.16 
 
 		 409 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  30.15 
 
 		 407 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.47 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  30.71 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  28.64 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  29.6 
 
 		 445 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  30.1 
 
 		 432 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  29.59 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.4 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  30.83 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  29.8 
 
 		 429 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  29.92 
 
 		 429 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.63 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  30.62 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  29.97 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  30.27 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  28.82 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  29.03 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  28.07 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  29.92 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  26.93 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  31.09 
 
 		 427 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  28.32 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  28.57 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  26.49 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  29.12 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.3 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  27.81 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  27.14 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  27.14 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  27.14 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>