199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4847 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  100 
 
 
376 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  40.42 
 
 
398 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  42.31 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  39.03 
 
 
397 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  40.57 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  38.78 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  40.48 
 
 
397 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  38.81 
 
 
405 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  38.3 
 
 
401 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  38.54 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  39.59 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  38.02 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  38.28 
 
 
399 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  38.28 
 
 
399 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.06 
 
 
413 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  39.28 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.55 
 
 
399 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  39.59 
 
 
394 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  37.33 
 
 
400 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  39.23 
 
 
394 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  38.11 
 
 
399 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  39.84 
 
 
399 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  39.74 
 
 
394 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  39.49 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  39.49 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  38.44 
 
 
401 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  37.94 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  39.74 
 
 
394 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  37.82 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  40.8 
 
 
413 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.56 
 
 
395 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.03 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  34.97 
 
 
395 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.75 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  31.76 
 
 
414 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  31.76 
 
 
421 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  32.02 
 
 
414 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  31.76 
 
 
421 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  31.03 
 
 
413 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  33.98 
 
 
414 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  32.2 
 
 
415 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  31.5 
 
 
421 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  33.7 
 
 
460 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  33.7 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  31.41 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  31.41 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  31.68 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  31.41 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  29.29 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  30.97 
 
 
413 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  31.41 
 
 
416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  31.03 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  34.54 
 
 
460 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  34.54 
 
 
460 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  33.43 
 
 
460 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  34.54 
 
 
460 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  34.54 
 
 
460 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.04 
 
 
462 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.87 
 
 
459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  31.14 
 
 
403 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  30.13 
 
 
464 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  28.07 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  30.1 
 
 
411 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  30.23 
 
 
413 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.54 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.98 
 
 
409 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  31.46 
 
 
409 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.26 
 
 
409 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  29.5 
 
 
415 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  27.72 
 
 
433 aa  122  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  30.3 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.32 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  29.46 
 
 
432 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.17 
 
 
424 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  29.74 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  30.32 
 
 
406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  30.41 
 
 
425 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.32 
 
 
429 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.48 
 
 
412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  28.5 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  29.44 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  29.7 
 
 
423 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  29.04 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  29.55 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.61 
 
 
422 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  28.07 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  29.55 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  27.69 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  28.24 
 
 
426 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  28.24 
 
 
426 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  28.24 
 
 
426 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.18 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.42 
 
 
413 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  27.53 
 
 
407 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  29.83 
 
 
436 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  27.85 
 
 
417 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  27.99 
 
 
426 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  27.99 
 
 
426 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  26.83 
 
 
439 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  28.53 
 
 
422 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>