218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2518 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  100 
 
 		 399 aa  797    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  45.54 
 
 		 406 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  43.98 
 
 		 413 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  43.07 
 
 		 411 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  45.61 
 
 		 409 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  43.92 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  40.49 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  41.35 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  33.01 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  34.29 
 
 		 407 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.03 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  34.23 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  32.38 
 
 		 432 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  31.75 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.02 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  31.44 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  31.92 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.11 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.65 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1495  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.23 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  32.63 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.99 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.99 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.47 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.21 
 
 		 413 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.84 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  29.92 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  28.28 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.43 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.61 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.54 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  29.02 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  29.02 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  29.02 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04228  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06270)  29.09 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  26.02 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  29.02 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  26.02 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  29.02 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  29.02 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  25.74 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.78 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  30.79 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  28.45 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.75 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  26.85 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  28.17 
 
 		 431 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  27.72 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  27.37 
 
 		 430 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  25.51 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  32 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  28.05 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  27.18 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  27.78 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  25.51 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.8 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  28.78 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.17 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.41 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  28.74 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  28.65 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.01 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  30.21 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  26.15 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  30.99 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  30.11 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.98 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.5 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  27.27 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  26.21 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  27.75 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  25.88 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  23.17 
 
 		 420 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  23.17 
 
 		 420 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  26.53 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  26.77 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  31.33 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  27.86 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  26.26 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  28.49 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  26.26 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  26.26 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  27.88 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  22.19 
 
 		 418 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  29.73 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  27.34 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  28.17 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.84 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.77 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 427 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  27.62 
 
 		 425 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  29.92 
 
 		 393 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  29.69 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  29.69 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  25.77 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>