198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0384 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00279  deaminase  98.79 
 
 
460 aa  855    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  98.79 
 
 
460 aa  855    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  98.79 
 
 
460 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  98.79 
 
 
460 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  88.38 
 
 
459 aa  772    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  98.79 
 
 
460 aa  855    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  99.03 
 
 
460 aa  855    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  100 
 
 
414 aa  862    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  99.76 
 
 
414 aa  860    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  65.13 
 
 
464 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  64.81 
 
 
462 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  51.61 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  50.25 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  42.86 
 
 
413 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  42.72 
 
 
415 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  42.47 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  42.36 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  43 
 
 
416 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  43 
 
 
416 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  43.24 
 
 
416 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  42.75 
 
 
416 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  42.75 
 
 
414 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  40.99 
 
 
421 aa  298  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  40.49 
 
 
421 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  40.49 
 
 
414 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  40.74 
 
 
421 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  40.49 
 
 
414 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  35.48 
 
 
403 aa  255  9e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  36 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  33.86 
 
 
398 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  33.25 
 
 
405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  32.67 
 
 
399 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  30.62 
 
 
400 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.98 
 
 
376 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  33.99 
 
 
401 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  34.91 
 
 
413 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  32.92 
 
 
399 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  32.92 
 
 
399 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  31.13 
 
 
401 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  31.83 
 
 
399 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.87 
 
 
399 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  32.61 
 
 
399 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  32.92 
 
 
399 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.09 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  33.13 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  33.33 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  29.41 
 
 
397 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  32.9 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  33.74 
 
 
405 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  34.17 
 
 
413 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  32.86 
 
 
394 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  32 
 
 
397 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  31.52 
 
 
398 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  31.18 
 
 
395 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  31.7 
 
 
394 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  32.86 
 
 
394 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  32.57 
 
 
394 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  32.57 
 
 
394 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  31.53 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.78 
 
 
395 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.08 
 
 
410 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  32.29 
 
 
394 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  26.28 
 
 
409 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  25.99 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  26.42 
 
 
406 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  24.87 
 
 
413 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.2 
 
 
409 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 
427 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  25.25 
 
 
412 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  25.06 
 
 
417 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  24.36 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.74 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  24.51 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  24.51 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  24.51 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  24.51 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  24.51 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  24.51 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  22.34 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  26.45 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.78 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.66 
 
 
428 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  23.87 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  25 
 
 
418 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.8 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  27.09 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.65 
 
 
425 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.61 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.18 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  27.05 
 
 
425 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.65 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.65 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  27.38 
 
 
424 aa  89.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.65 
 
 
413 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  27.18 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  23.81 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  26.87 
 
 
423 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.12 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  25.93 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  23.58 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>