More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3184 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  100 
 
 
393 aa  762    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  45.69 
 
 
394 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  45.94 
 
 
394 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  45.18 
 
 
394 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  45.43 
 
 
394 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  45.43 
 
 
394 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  46.38 
 
 
414 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  45.18 
 
 
394 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.3 
 
 
395 aa  292  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  46.74 
 
 
399 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  44.5 
 
 
401 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  47.1 
 
 
399 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  45.43 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  44.22 
 
 
405 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  43.77 
 
 
397 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  42.16 
 
 
398 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  45.18 
 
 
394 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.89 
 
 
410 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  44.41 
 
 
400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  43.24 
 
 
398 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.82 
 
 
376 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  43.59 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.93 
 
 
413 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.43 
 
 
409 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  42.5 
 
 
399 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  42.5 
 
 
399 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  42.5 
 
 
399 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  43.87 
 
 
397 aa  247  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  40.98 
 
 
401 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  42.11 
 
 
399 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  43.62 
 
 
399 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  39.94 
 
 
405 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  40.12 
 
 
405 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  37.14 
 
 
413 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  35.75 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  35.75 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  36.02 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  36.02 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  39.79 
 
 
464 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  41.28 
 
 
413 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  36.6 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  36.1 
 
 
413 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  35.75 
 
 
421 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  35.81 
 
 
415 aa  212  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  36.8 
 
 
460 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  34.44 
 
 
416 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  34.44 
 
 
416 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  34.69 
 
 
416 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  34.44 
 
 
414 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  34.44 
 
 
416 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  36.27 
 
 
414 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  38.62 
 
 
462 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  36 
 
 
414 aa  206  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  35.73 
 
 
460 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  35.73 
 
 
460 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  35.73 
 
 
460 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  35.73 
 
 
460 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  35.73 
 
 
460 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  35.81 
 
 
459 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  29.9 
 
 
409 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  35.77 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  33.68 
 
 
403 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  34.06 
 
 
445 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  34.84 
 
 
432 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.73 
 
 
407 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  33.49 
 
 
427 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.11 
 
 
409 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  30.85 
 
 
411 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  32.58 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  33.41 
 
 
429 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.6 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  30.17 
 
 
426 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  29.93 
 
 
426 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  29.93 
 
 
426 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  31.48 
 
 
422 aa  149  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  32.22 
 
 
429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  29.78 
 
 
426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  32.69 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.37 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  32.93 
 
 
429 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  30.73 
 
 
433 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  29.68 
 
 
426 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  30.05 
 
 
427 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  29.56 
 
 
427 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.56 
 
 
427 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  29.56 
 
 
427 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  29.56 
 
 
427 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  33.65 
 
 
429 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  29.56 
 
 
427 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  29.56 
 
 
427 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.46 
 
 
413 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.46 
 
 
413 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  33.65 
 
 
431 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  31.02 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.69 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  30.66 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  29.31 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  33.17 
 
 
423 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  32.36 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  28.93 
 
 
413 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>