233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5236 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  94.92 
 
 
394 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  91.12 
 
 
394 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  98.22 
 
 
394 aa  765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  92.89 
 
 
394 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  100 
 
 
394 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  92.89 
 
 
394 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  100 
 
 
394 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  65.9 
 
 
405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  64.38 
 
 
401 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  61.89 
 
 
398 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  47.21 
 
 
397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  45.66 
 
 
399 aa  322  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  41.39 
 
 
398 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  45.43 
 
 
393 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.08 
 
 
399 aa  292  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  43.15 
 
 
400 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.03 
 
 
395 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.26 
 
 
413 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  39.45 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  41.41 
 
 
395 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  43.33 
 
 
401 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  40.94 
 
 
414 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  41.05 
 
 
399 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.42 
 
 
409 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  40.5 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  40.5 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  40.22 
 
 
399 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  42.09 
 
 
405 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  42.58 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  40.92 
 
 
405 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.49 
 
 
376 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  43.45 
 
 
397 aa  235  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.72 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  42.67 
 
 
413 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  33.33 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  33.33 
 
 
421 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  33.07 
 
 
421 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  33.07 
 
 
414 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  34.31 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  33.33 
 
 
414 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  32.61 
 
 
413 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  32.09 
 
 
416 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  32.09 
 
 
414 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  32.09 
 
 
416 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  32.09 
 
 
416 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  32.09 
 
 
416 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  32.35 
 
 
415 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  32.08 
 
 
413 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.75 
 
 
462 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  31.97 
 
 
427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  29.06 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  31.15 
 
 
464 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  29.56 
 
 
403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  32.57 
 
 
414 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  32.57 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  33.71 
 
 
459 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  32.29 
 
 
460 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  32.29 
 
 
460 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  32 
 
 
460 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  32 
 
 
460 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  32 
 
 
460 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  32 
 
 
460 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  29.29 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.43 
 
 
428 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  32.02 
 
 
432 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  29.27 
 
 
445 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  29.41 
 
 
407 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  32.6 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  27.36 
 
 
433 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.38 
 
 
409 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  29.09 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  29.09 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  30.58 
 
 
440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  28.85 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  34.29 
 
 
432 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  28.61 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  32.05 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  31.28 
 
 
430 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  30.3 
 
 
429 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  30.29 
 
 
424 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  31.54 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  28.61 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  29.82 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  29.82 
 
 
436 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  29.82 
 
 
436 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.94 
 
 
412 aa  131  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  25.06 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  29.44 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.73 
 
 
423 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  28.42 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  31.04 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  31.38 
 
 
415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  28.42 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  28.42 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  28.42 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.42 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  28.42 
 
 
427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  29.06 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  28.42 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  32.72 
 
 
427 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>