218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0538 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  100 
 
 		 399 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.75 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  49.38 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  44.08 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  45.48 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  43.32 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  42.78 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  43.18 
 
 		 397 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  43.07 
 
 		 394 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  40.85 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  46.85 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  43.07 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  43.07 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  42.57 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  41.69 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  38.68 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  41.16 
 
 		 400 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  41.83 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  42.42 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.59 
 
 		 413 aa  252  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  41.32 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  40.7 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  37.43 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  37.32 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  40.35 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  39.66 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  39.66 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  39.19 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.42 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.55 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  39.09 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  39.59 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  32.66 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  39.42 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  35.23 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  31.98 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  33.16 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  36.49 
 
 		 397 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  33.07 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  33.07 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  33.07 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  33.33 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  33.07 
 
 		 416 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  31.81 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  31.81 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  31.81 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  31.81 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  31.52 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  32.37 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  32.87 
 
 		 414 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.99 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  32.37 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  32.6 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  32.6 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  32.6 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  31.04 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  32.6 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  32.87 
 
 		 460 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  29.14 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  33.33 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  31.73 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  27.34 
 
 		 409 aa  156  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  28.77 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.68 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.67 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  31.33 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.65 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  29.33 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  32.45 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.59 
 
 		 417 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.68 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.03 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.39 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  28.79 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.61 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  27.69 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  26.97 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  30.41 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  31.61 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  24.52 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  27.54 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  29.05 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.42 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  26.47 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  26.5 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  26.76 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  27.15 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.96 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  32.96 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  27.8 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  29.35 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.72 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  28.17 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  27.81 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  27.81 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  29.35 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  29.35 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>