219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1451 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  100 
 
 
395 aa  762    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  74.94 
 
 
395 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  63.52 
 
 
414 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  45.94 
 
 
393 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  42.89 
 
 
394 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  43.37 
 
 
401 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  42.78 
 
 
394 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  43.29 
 
 
394 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  42.53 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  40.74 
 
 
410 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  43.65 
 
 
394 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  43.65 
 
 
394 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  42.89 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  44.3 
 
 
394 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  40.66 
 
 
398 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  39.03 
 
 
397 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  35.73 
 
 
398 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.24 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  39.37 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.08 
 
 
409 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  36.15 
 
 
399 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  38.04 
 
 
399 aa  235  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  39.5 
 
 
399 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  39.5 
 
 
399 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  39.5 
 
 
399 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  38.94 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.14 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  39.94 
 
 
397 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  36.55 
 
 
401 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  39.59 
 
 
405 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.53 
 
 
376 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  37.83 
 
 
405 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  38.66 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  33.71 
 
 
414 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  36.86 
 
 
413 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  33.71 
 
 
421 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  33.43 
 
 
414 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  33.15 
 
 
421 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  33.14 
 
 
421 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  31.5 
 
 
413 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  33.59 
 
 
462 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  30.13 
 
 
416 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  30.13 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  29.68 
 
 
416 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  29.87 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  30.71 
 
 
415 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  29.87 
 
 
416 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  30.59 
 
 
413 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  30.32 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  31.55 
 
 
460 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  31.83 
 
 
460 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  31.83 
 
 
460 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  31.48 
 
 
464 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  31.83 
 
 
460 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  31.83 
 
 
460 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  29.72 
 
 
445 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  31.73 
 
 
459 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  31.83 
 
 
414 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  31.83 
 
 
414 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  32.18 
 
 
403 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  28.05 
 
 
409 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  31.83 
 
 
460 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  29.73 
 
 
445 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  28.98 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  30.35 
 
 
422 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.38 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  30.45 
 
 
407 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  30.81 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  31.99 
 
 
415 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.74 
 
 
413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  26.85 
 
 
411 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.64 
 
 
413 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  28.93 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.74 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  28.43 
 
 
418 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  28.43 
 
 
418 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  28.43 
 
 
418 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.12 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  28.43 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  28.43 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  28.43 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.12 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.12 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  27.47 
 
 
417 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.79 
 
 
413 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.5 
 
 
399 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  27.45 
 
 
426 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  27.45 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  27.45 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  28.88 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  27.45 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.37 
 
 
428 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  28.36 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  29.31 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  27.21 
 
 
426 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  26.15 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  31.52 
 
 
436 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  29.38 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  27.63 
 
 
429 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.21 
 
 
413 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>