254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0068 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  100 
 
 
394 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  94.92 
 
 
394 aa  685    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  91.62 
 
 
394 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  91.88 
 
 
394 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  94.16 
 
 
394 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  94.92 
 
 
394 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  90.86 
 
 
394 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  63.61 
 
 
401 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  65.38 
 
 
405 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  61.38 
 
 
398 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  46.45 
 
 
397 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  44.64 
 
 
399 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  41.73 
 
 
398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  45.18 
 
 
393 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  42.39 
 
 
400 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.07 
 
 
399 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.24 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  42.49 
 
 
395 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.26 
 
 
413 aa  279  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  42.61 
 
 
399 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  41.83 
 
 
414 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  42.78 
 
 
401 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.2 
 
 
409 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  40.34 
 
 
399 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  40.34 
 
 
399 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  40.67 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  40.11 
 
 
399 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  40.59 
 
 
405 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  41.74 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.23 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  39.67 
 
 
405 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.72 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  41.51 
 
 
397 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  41.51 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  34.22 
 
 
421 aa  205  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  33.96 
 
 
421 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  33.69 
 
 
421 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  33.96 
 
 
414 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  33.69 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  33.42 
 
 
413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  31.82 
 
 
416 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  31.82 
 
 
416 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  31.82 
 
 
414 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  31.81 
 
 
413 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  31.82 
 
 
416 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  31.82 
 
 
416 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  35.53 
 
 
462 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  31.54 
 
 
415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  31 
 
 
413 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  29.88 
 
 
409 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  31.41 
 
 
464 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  31.25 
 
 
427 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  28.68 
 
 
403 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  32.86 
 
 
414 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  32.86 
 
 
414 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  33.43 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  32.86 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  32.29 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  32.29 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  32.29 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  32.29 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  32.29 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  30.08 
 
 
445 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  29.81 
 
 
445 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  33.09 
 
 
422 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.67 
 
 
428 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  32.03 
 
 
440 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  31.86 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  31.6 
 
 
432 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  27.68 
 
 
433 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  30.98 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  33.76 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  31.54 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  29.17 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  31.14 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  31.14 
 
 
430 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.98 
 
 
423 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  29.16 
 
 
426 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  29.16 
 
 
426 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  30.99 
 
 
424 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  30.56 
 
 
426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.07 
 
 
413 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.92 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  33.25 
 
 
432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  31.2 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  28.92 
 
 
426 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.62 
 
 
409 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  30.1 
 
 
432 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  28.92 
 
 
426 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.09 
 
 
413 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.43 
 
 
412 aa  132  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  29.66 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  29.06 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  30 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  28.61 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  29.66 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  32.13 
 
 
429 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  30.26 
 
 
406 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  29.82 
 
 
432 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  29.82 
 
 
436 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>