228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4900 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  91.88 
 
 		 394 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  90.36 
 
 		 394 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  92.89 
 
 		 394 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  100 
 
 		 394 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  92.89 
 
 		 394 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  98.48 
 
 		 394 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  92.13 
 
 		 394 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  64.12 
 
 		 401 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  65.98 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  61.64 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  47.72 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  44.1 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  45.69 
 
 		 393 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  40.1 
 
 		 398 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.08 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  43.68 
 
 		 400 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.84 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.86 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  39.45 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  42.13 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.75 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  43.77 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  40.83 
 
 		 399 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  40.83 
 
 		 399 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  41.39 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  42.63 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  40.56 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  41.73 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  42.82 
 
 		 401 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  42.94 
 
 		 399 aa  245  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  44.05 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  37.16 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.59 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  41.76 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  32.89 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  33.42 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  32.89 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  31.23 
 
 		 413 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  32.62 
 
 		 414 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  32.62 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  32.63 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  32.63 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  32.63 
 
 		 416 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  32.89 
 
 		 414 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  32.63 
 
 		 416 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  32.63 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  31.75 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  30.23 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  29.63 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.64 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  31.97 
 
 		 427 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  30.75 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  32.19 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.66 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  31.7 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  31.7 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  31.7 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  31.25 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  34.24 
 
 		 422 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  31.12 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  31.12 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  31.12 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.92 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  30.15 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  31.84 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  32.9 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  28.22 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  27.18 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  31.71 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.65 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  27.73 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  31.06 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  32.15 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  29.17 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  30.79 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  28.92 
 
 		 426 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  32.15 
 
 		 430 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  32.22 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  29.31 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  28.85 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  31.7 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  30.43 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  29.31 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.64 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  33.77 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.06 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.17 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  30.96 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.92 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  28.3 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  27.05 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  28.81 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  31.73 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  32.31 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  28.02 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  29.22 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>