185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3622 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  100 
 
 		 403 aa  823    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  42.54 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  42.29 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  42.29 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  42.54 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  42.29 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  40.65 
 
 		 413 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  40.4 
 
 		 415 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  39.9 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  40.94 
 
 		 421 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  39.65 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  40.45 
 
 		 421 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  40.45 
 
 		 414 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  40.45 
 
 		 414 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  40.45 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  35.78 
 
 		 464 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.99 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  35.48 
 
 		 414 aa  255  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  35.24 
 
 		 414 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  35.24 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  35.24 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  35.24 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  35.24 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  35.05 
 
 		 459 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  34.74 
 
 		 460 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  34.99 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  35.07 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  35.09 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  30.2 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  33.89 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  34.19 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  35.28 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  32.98 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  33.42 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  31.82 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  33.02 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  33.61 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  34.67 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  30.5 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  33.97 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  33.97 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  32.84 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  29.7 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  30.75 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  32.45 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  30.59 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  31.5 
 
 		 398 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  31.19 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.48 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  33.12 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  30.75 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.89 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  31.11 
 
 		 397 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  28.68 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.74 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.14 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  30.46 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.4 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  30.69 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  25.56 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 432 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  23.48 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  24.63 
 
 		 412 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  25.38 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  25 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  23.23 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  26.28 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  25 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  23.99 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  23.77 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  26.29 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.04 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  25.72 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  26.3 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  25.35 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  25.19 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.07 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  24.37 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  23.98 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.07 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.07 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  26.06 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  24.07 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  23.62 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.65 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  25.93 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  25.31 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  22.76 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.14 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.47 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  23.31 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  24.93 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  25.06 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.73 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  23.33 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.47 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>