198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05319 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  75.48 
 
 		 427 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  75.48 
 
 		 427 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  72.68 
 
 		 436 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  76.78 
 
 		 426 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  75.48 
 
 		 427 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  75.24 
 
 		 427 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  72.68 
 
 		 432 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  75.48 
 
 		 427 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  84 
 
 		 425 aa  770    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  95.29 
 
 		 425 aa  851    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  75.48 
 
 		 427 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  76.78 
 
 		 426 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  76.78 
 
 		 426 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  82.67 
 
 		 432 aa  756    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  76.54 
 
 		 426 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  72.68 
 
 		 436 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  100 
 
 		 425 aa  886    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  76.78 
 
 		 426 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  75.48 
 
 		 427 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  75.48 
 
 		 427 aa  666    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  82.24 
 
 		 431 aa  755    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  73.16 
 
 		 422 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  83.88 
 
 		 431 aa  761    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  72.44 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  71.09 
 
 		 423 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  71.09 
 
 		 423 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  56.76 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  57.89 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  57.28 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  56.3 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  55.72 
 
 		 411 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  54.37 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  56.4 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  55.26 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  54.77 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.48 
 
 		 413 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.96 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.24 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.24 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.96 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.22 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  52.76 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.48 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  51.6 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  51.6 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  54.52 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  54.52 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  51.6 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  51.6 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  51.6 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  51.6 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  50.62 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  51.93 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  46.24 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  45.12 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  43.84 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  43.54 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  43.03 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  42.62 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  43.33 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  43.14 
 
 		 419 aa  350  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  42.15 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  43.79 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  43.99 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  42.62 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  40.62 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  41.25 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  41.77 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  42.34 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  39.81 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  42.36 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  40.28 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  41.41 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  40.72 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  40.62 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  40.14 
 
 		 431 aa  332  6e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  41.88 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  40.9 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  40.09 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  43.13 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  40.47 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  40.25 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  38.68 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  40.41 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  39.95 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  41.24 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  32.35 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.93 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  29.71 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.56 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  28.68 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  27.18 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1495  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.18 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  28.01 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  29.37 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  27.52 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.74 
 
 		 473 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  28.88 
 
 		 401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>