202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5276 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  83.78 
 
 		 429 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  84.86 
 
 		 429 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  100 
 
 		 370 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  88.32 
 
 		 432 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  78.32 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  68.89 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  68.7 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  68.7 
 
 		 426 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  68.7 
 
 		 432 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  68.42 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  68.98 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  69.53 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  66.39 
 
 		 425 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  66.39 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  67.31 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  66.01 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  68.31 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  65.58 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  65.66 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  65.93 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  65 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  64.82 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  62.78 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  62.5 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  63.06 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  65.12 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  61.77 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  63.46 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  47.06 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  46.43 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  46.43 
 
 		 423 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  44.51 
 
 		 427 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  44.51 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  44.51 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  44.51 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  44.23 
 
 		 427 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.23 
 
 		 427 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  43.41 
 
 		 426 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  44.23 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  44.23 
 
 		 432 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  43.41 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  43.41 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  44.23 
 
 		 436 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  44.23 
 
 		 436 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  43.41 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  44.23 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  43.13 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  45.06 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  43.54 
 
 		 422 aa  312  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  45.1 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  42.65 
 
 		 425 aa  308  9e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.06 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  45.24 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.52 
 
 		 412 aa  305  7e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.22 
 
 		 418 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  45.24 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  45.53 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  45.24 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  45.24 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  42.03 
 
 		 431 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.8 
 
 		 413 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  45.24 
 
 		 418 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  45.24 
 
 		 418 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  45.24 
 
 		 418 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.52 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.8 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.24 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.24 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.67 
 
 		 413 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  41.24 
 
 		 425 aa  298  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.67 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  40.85 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.67 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.67 
 
 		 413 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  40.17 
 
 		 432 aa  296  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.52 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.9 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  43.07 
 
 		 410 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  42.36 
 
 		 412 aa  288  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  40.58 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  40.63 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  42.26 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  38.57 
 
 		 420 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  38.57 
 
 		 420 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  36.94 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  37.94 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  35.19 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  34.6 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  31.25 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  32.72 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  29.87 
 
 		 433 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  29.64 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  31.07 
 
 		 437 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  28.2 
 
 		 438 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  29.22 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  27.6 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.76 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  30.67 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  31.46 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>