236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0258 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  100 
 
 
412 aa  852    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  56.97 
 
 
431 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  54.59 
 
 
425 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  55.18 
 
 
425 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  54.57 
 
 
431 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  55 
 
 
432 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  55.58 
 
 
426 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  55.58 
 
 
426 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  55.58 
 
 
426 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  54.37 
 
 
425 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  55.83 
 
 
426 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  56.3 
 
 
426 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  57.22 
 
 
436 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  56.23 
 
 
427 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  57.22 
 
 
436 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  55.85 
 
 
427 aa  474  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  57.22 
 
 
432 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  55.75 
 
 
427 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  55.12 
 
 
433 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  55.75 
 
 
427 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  55.75 
 
 
427 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  55.75 
 
 
427 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  55.75 
 
 
427 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  55.5 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  58.81 
 
 
413 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  58.27 
 
 
413 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  57.52 
 
 
413 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  59.08 
 
 
413 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  54.26 
 
 
422 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  54.95 
 
 
411 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  56.01 
 
 
412 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  54.72 
 
 
423 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  54.72 
 
 
423 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  54.43 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  58.45 
 
 
412 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.94 
 
 
413 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.94 
 
 
413 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  55.5 
 
 
417 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  56.68 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  56.68 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  52.71 
 
 
417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.94 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  53.69 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  56.68 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  56.68 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  56.68 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  56.68 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  55.79 
 
 
418 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  52.33 
 
 
413 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  52.26 
 
 
428 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  51.83 
 
 
418 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  50.84 
 
 
420 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  50.84 
 
 
420 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  49.25 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  47.2 
 
 
422 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  43.45 
 
 
423 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  41.93 
 
 
419 aa  350  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  43.67 
 
 
430 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  42.05 
 
 
418 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  43.42 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  43.07 
 
 
429 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  42.57 
 
 
432 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  42.68 
 
 
429 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  42.2 
 
 
426 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  42.23 
 
 
426 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  42.82 
 
 
429 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  42.48 
 
 
424 aa  339  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  41.02 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  43.22 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  41.75 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  42.09 
 
 
427 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  41.61 
 
 
432 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  40.39 
 
 
440 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  43 
 
 
431 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  40.91 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  42.36 
 
 
429 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  40.93 
 
 
423 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  40.29 
 
 
424 aa  319  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  41.44 
 
 
425 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  42.97 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  43.52 
 
 
370 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  41.45 
 
 
422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  41.3 
 
 
410 aa  298  9e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  38.85 
 
 
425 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  38.6 
 
 
425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  38.85 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 
409 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  32.25 
 
 
407 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  30.83 
 
 
411 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  27.64 
 
 
432 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.16 
 
 
409 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  32.62 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  26 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1495  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.7 
 
 
423 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  33.42 
 
 
398 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  29.43 
 
 
405 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  29.59 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  31.5 
 
 
399 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  28.91 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  29.31 
 
 
397 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>