231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2654 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  85.51 
 
 		 423 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  72.99 
 
 		 432 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  83.06 
 
 		 425 aa  738    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  100 
 
 		 426 aa  866    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  75.06 
 
 		 425 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  82.66 
 
 		 424 aa  723    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  71.73 
 
 		 423 aa  631  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  71.76 
 
 		 430 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  70.52 
 
 		 424 aa  628  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  71.67 
 
 		 423 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  71.53 
 
 		 430 aa  624  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  72.6 
 
 		 429 aa  619  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  70.55 
 
 		 426 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  66.9 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  70.8 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  68.63 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  65.06 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  64.58 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  65.07 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  70.18 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  63.88 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  62.38 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  63.86 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  67.15 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  62.14 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  62.14 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  62.41 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  66.01 
 
 		 370 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  46.23 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  46.23 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  47.33 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  46.23 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  46.47 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  45.52 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  44.92 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  45.72 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.72 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  46.34 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  46.34 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  46.34 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  45.97 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  46.1 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  45.72 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  43.37 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  47.01 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  46.9 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  46.9 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  46.9 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  41.61 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  43.03 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  43.2 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  47.63 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  47.63 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  47.37 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  41.61 
 
 		 425 aa  352  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  42.45 
 
 		 431 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.23 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.6 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  47.39 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  47.39 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  47.39 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.93 
 
 		 413 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.87 
 
 		 413 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  47.39 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  47.39 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  47.39 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.23 
 
 		 412 aa  341  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  47.15 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  44.66 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.61 
 
 		 418 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.75 
 
 		 413 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  47.55 
 
 		 412 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.75 
 
 		 413 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  44.42 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.5 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.41 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.41 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.9 
 
 		 413 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.28 
 
 		 417 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  44.03 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  41.01 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  40.1 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  40.1 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  39.45 
 
 		 418 aa  299  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  41.07 
 
 		 439 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  36.66 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  31.11 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  32.92 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  34.5 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  30.05 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  34.38 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  33.86 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  29.81 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  31.1 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.92 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  30.32 
 
 		 415 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.99 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  31.23 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>