238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2102 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  100 
 
 		 406 aa  825    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  54.32 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  50.61 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  47.41 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  53.89 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  52.26 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  48.89 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.54 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  40.99 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  35.37 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.46 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  30.73 
 
 		 429 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  30.47 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  30 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  30.77 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  31.03 
 
 		 430 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  30.99 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  32.82 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  29.83 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  29.83 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  30.81 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  30.91 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  28.61 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  28.54 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.54 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  28.61 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  28.61 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  28.61 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  28.54 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  30.55 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  29.95 
 
 		 422 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  29.34 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  30.47 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  30 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  30.31 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.57 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.68 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  29.37 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  31.91 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.78 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  29.67 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.73 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  30.18 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.61 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.61 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.34 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  29.51 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  30.47 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  30.08 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  28.39 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  28.07 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  29.17 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  29.07 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  29.22 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.35 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  29.62 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.22 
 
 		 413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  29.62 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  28.82 
 
 		 432 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.49 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  29.44 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  29.79 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  28.88 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  28.88 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  28.88 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  28.11 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.85 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  27.22 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  27.65 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  27.52 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.98 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  30.79 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  27.08 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.27 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  27.65 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  32.5 
 
 		 436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  28.94 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.99 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  31.62 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.68 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  28.15 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  27.56 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.95 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  27.22 
 
 		 432 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  27.37 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  26.83 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.77 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  26.07 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>