196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3872 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  100 
 
 
393 aa  803    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  38.6 
 
 
398 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  38.08 
 
 
399 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  44.76 
 
 
423 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  36.1 
 
 
437 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  31.93 
 
 
438 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  32.1 
 
 
438 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  33.33 
 
 
464 aa  223  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  34.2 
 
 
438 aa  219  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  34.88 
 
 
437 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  31.96 
 
 
433 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  35.39 
 
 
444 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  39.38 
 
 
445 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  36.03 
 
 
458 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  34.49 
 
 
459 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  34.94 
 
 
460 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  33.75 
 
 
456 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  34.22 
 
 
455 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  34.27 
 
 
424 aa  192  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  35.13 
 
 
442 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  31.45 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  31.62 
 
 
425 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  27.79 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  27.79 
 
 
437 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  31.41 
 
 
409 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  29.34 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.92 
 
 
409 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  29.63 
 
 
421 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  25.07 
 
 
410 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  26.67 
 
 
411 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  27.08 
 
 
413 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  27.7 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  33.42 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  27.94 
 
 
406 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  26.36 
 
 
431 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  27.93 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  25.34 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  28.04 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  28.04 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  28.04 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  28.73 
 
 
426 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  25.87 
 
 
411 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.85 
 
 
407 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  31.35 
 
 
415 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  31.3 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  25.53 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  28.74 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  26.99 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  26.99 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.33 
 
 
428 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.93 
 
 
413 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  25.67 
 
 
425 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  27.07 
 
 
422 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  30.69 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  28.81 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  28.81 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  27.42 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  26.68 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  26.23 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.68 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.94 
 
 
413 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  29.71 
 
 
432 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.45 
 
 
412 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  29.67 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.75 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.73 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  26.89 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  29.57 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  26.58 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  26.61 
 
 
427 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  26.61 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  23.37 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  29.65 
 
 
425 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  27.65 
 
 
427 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.65 
 
 
427 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.69 
 
 
436 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.69 
 
 
436 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  26.61 
 
 
427 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  26.13 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  27.5 
 
 
439 aa  116  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  26.63 
 
 
418 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  27.65 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  29.44 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  29.87 
 
 
427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  27.96 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  29.52 
 
 
426 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  26.33 
 
 
427 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  24.94 
 
 
412 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  25.94 
 
 
418 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  25.94 
 
 
418 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  25.94 
 
 
418 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  30.29 
 
 
429 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  28.64 
 
 
415 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.01 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.66 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.75 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  25.69 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  25.69 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  25.69 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>