286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4568 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  79.15 
 
 		 423 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  86.82 
 
 		 432 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  77.73 
 
 		 423 aa  684    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  77.86 
 
 		 430 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  77.86 
 
 		 430 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  76.4 
 
 		 429 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  100 
 
 		 426 aa  862    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  75.89 
 
 		 429 aa  651    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  74.82 
 
 		 425 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  72.27 
 
 		 424 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  69.88 
 
 		 425 aa  614  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  70.55 
 
 		 426 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  69.29 
 
 		 432 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  71.56 
 
 		 423 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  74.21 
 
 		 440 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  68.65 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  69.12 
 
 		 424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  72.55 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  67.38 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  67.62 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  69.45 
 
 		 422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  66.67 
 
 		 431 aa  564  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  67.3 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  66.59 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  66.35 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  61.52 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  66.75 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  68.7 
 
 		 370 aa  514  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  48.81 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  46.91 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  46.67 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  46.31 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  46.67 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  46.31 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  46.31 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  46.67 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  46.42 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  45.43 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  48.51 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  45.43 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  45.43 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  48.51 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  45.43 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  45.19 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.19 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  45.19 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  45.19 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  43.68 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  45.43 
 
 		 422 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  42.17 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  44.26 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.2 
 
 		 412 aa  342  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.23 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  45.99 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  42.36 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  43.38 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.3 
 
 		 418 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  43.33 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.1 
 
 		 413 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  46.15 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.27 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  41.4 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.9 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.1 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  42.25 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.64 
 
 		 413 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.13 
 
 		 413 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.64 
 
 		 413 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.13 
 
 		 413 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  46.22 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  45.32 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  45.32 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  45.32 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  45.32 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  45.32 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  45.32 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.86 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  44.81 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  44.78 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  43.93 
 
 		 417 aa  318  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  41.06 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  36.05 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  36.05 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  37.94 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  35.58 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  36.83 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  31.44 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  33.09 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  31.66 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  30.83 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  30.5 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1495  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.94 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  30.79 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  32.38 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  32.87 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  32.32 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  29.17 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.62 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.46 
 
 		 409 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  27.03 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>