197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5704 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  100 
 
 
436 aa  858    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  50.6 
 
 
415 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  34.99 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  30.44 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  36.36 
 
 
422 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  33.25 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  34.12 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  30.64 
 
 
426 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  32.75 
 
 
429 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  28.77 
 
 
431 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  30.4 
 
 
426 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  30.4 
 
 
426 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.7 
 
 
413 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  30.5 
 
 
433 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  34.27 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  30.84 
 
 
427 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.56 
 
 
411 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  34.27 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  34.27 
 
 
418 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  34.04 
 
 
418 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  33.09 
 
 
423 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  34.27 
 
 
418 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  34.27 
 
 
418 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  34.27 
 
 
418 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  30.37 
 
 
427 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  34.64 
 
 
431 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  30.17 
 
 
426 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  30.37 
 
 
427 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  30.37 
 
 
427 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.37 
 
 
427 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  30.37 
 
 
427 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  31.32 
 
 
422 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  30.17 
 
 
426 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.85 
 
 
417 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  30.37 
 
 
427 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.05 
 
 
412 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  30.37 
 
 
427 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.94 
 
 
407 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  32.14 
 
 
423 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.47 
 
 
413 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  30.88 
 
 
429 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  32.14 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  35.32 
 
 
432 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  33.6 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.57 
 
 
413 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  31.69 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.59 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.79 
 
 
413 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  32.62 
 
 
426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  35.34 
 
 
425 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.32 
 
 
413 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  31.65 
 
 
426 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  32.14 
 
 
432 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  30.5 
 
 
422 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  28.11 
 
 
425 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  33.52 
 
 
400 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.13 
 
 
418 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.62 
 
 
413 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.62 
 
 
413 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  29.25 
 
 
436 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  29.25 
 
 
436 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  29.25 
 
 
432 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  32.53 
 
 
429 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  32.11 
 
 
425 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  27.25 
 
 
432 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  35.34 
 
 
425 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.62 
 
 
413 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  27.82 
 
 
431 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  31.24 
 
 
417 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1495  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.09 
 
 
423 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  32.53 
 
 
424 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  34.81 
 
 
425 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  32.11 
 
 
432 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  37.09 
 
 
413 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  30.3 
 
 
410 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  33.03 
 
 
432 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  28.24 
 
 
425 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  28.24 
 
 
425 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  31.34 
 
 
424 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  32.62 
 
 
430 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  32.18 
 
 
425 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  31.34 
 
 
413 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  31.68 
 
 
423 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  33.16 
 
 
429 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  31.98 
 
 
423 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  32.82 
 
 
430 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  34.64 
 
 
405 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  30.31 
 
 
440 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  29.55 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  32.32 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  34.71 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  34.71 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  32.94 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  32.72 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  32.84 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  34.71 
 
 
399 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  32.09 
 
 
411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  34.08 
 
 
405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  32.94 
 
 
427 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>