More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4606 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  94.49 
 
 
399 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  100 
 
 
399 aa  795    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  97.49 
 
 
399 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  97.49 
 
 
399 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  86.72 
 
 
399 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  69.71 
 
 
405 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  68.41 
 
 
405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  62.53 
 
 
397 aa  461  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  50.52 
 
 
400 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  52.9 
 
 
413 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  44.01 
 
 
399 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  40.31 
 
 
398 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  41.04 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  43.94 
 
 
401 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  41.16 
 
 
401 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  41.41 
 
 
394 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  41.15 
 
 
394 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  40.16 
 
 
397 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  42.6 
 
 
393 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  38.64 
 
 
405 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  40.26 
 
 
394 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.02 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  44.29 
 
 
413 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  41.04 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  41.04 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  41.04 
 
 
394 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.9 
 
 
399 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  37.63 
 
 
398 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  39.74 
 
 
394 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.93 
 
 
395 aa  232  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.64 
 
 
409 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  35.45 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  37.96 
 
 
395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  35.22 
 
 
413 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  35.22 
 
 
415 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.78 
 
 
410 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  36.15 
 
 
414 aa  206  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  34.14 
 
 
413 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  33.87 
 
 
421 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  33.87 
 
 
414 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  33.6 
 
 
421 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  33.6 
 
 
414 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  33.98 
 
 
421 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  33.98 
 
 
416 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  33.98 
 
 
416 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  33.98 
 
 
414 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  33.98 
 
 
416 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  33.7 
 
 
416 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  30.48 
 
 
409 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  33.33 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  32.89 
 
 
460 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  31.97 
 
 
403 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.55 
 
 
462 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  32.63 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  32.36 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  32.36 
 
 
460 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  32.36 
 
 
460 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  32.36 
 
 
460 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  32.36 
 
 
460 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  32.1 
 
 
460 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.28 
 
 
459 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  31.81 
 
 
445 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  35.22 
 
 
432 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  32.11 
 
 
422 aa  173  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.3 
 
 
409 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  31.68 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  30.98 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  32.15 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  31.46 
 
 
429 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  31.8 
 
 
426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  35.21 
 
 
436 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  32.34 
 
 
423 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  32.34 
 
 
424 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.47 
 
 
428 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  28.78 
 
 
420 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  28.78 
 
 
420 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  31.98 
 
 
413 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  31.59 
 
 
425 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  31.33 
 
 
429 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  32.65 
 
 
425 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  32.61 
 
 
423 aa  156  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.28 
 
 
407 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  31.9 
 
 
432 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  30.56 
 
 
415 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  31.82 
 
 
427 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  33.24 
 
 
415 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.74 
 
 
412 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  30.28 
 
 
429 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  30 
 
 
429 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  30.81 
 
 
430 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  28.11 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  31.2 
 
 
426 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  28.11 
 
 
427 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  27.97 
 
 
427 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.97 
 
 
427 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  31.49 
 
 
430 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  28.11 
 
 
427 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  27.97 
 
 
427 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  28.11 
 
 
427 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  29.22 
 
 
439 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>