More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5235 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  97.49 
 
 		 399 aa  722    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  93.48 
 
 		 399 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  100 
 
 		 399 aa  797    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  100 
 
 		 399 aa  797    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  85.71 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  69.19 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  67.36 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  61.74 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  51.04 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  57.39 
 
 		 413 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  45.77 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  40.58 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  44.51 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  41.6 
 
 		 399 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  40.85 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  40.89 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  40.62 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  39.64 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  42.6 
 
 		 393 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  38.64 
 
 		 405 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  40 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  43.75 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.28 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  40.52 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  40.52 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  40.52 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.37 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  37.11 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  39.22 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.93 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.78 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  36 
 
 		 413 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  37.63 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  34.95 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  36.67 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  34.93 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  33.87 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  34.58 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  34.32 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  34.58 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  34.32 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.78 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  34.72 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  33.98 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  33.98 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  33.98 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  33.98 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  33.7 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  33.42 
 
 		 464 aa  195  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.9 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  32.63 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  31.95 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  32.44 
 
 		 445 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  32.36 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  33.14 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  32.1 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  32.1 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  32.1 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  32.1 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.28 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  31.83 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  34.96 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  32.11 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  32.81 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  31.47 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.03 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  31.49 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  35.21 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.84 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  31.55 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  28.78 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  28.78 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  31.54 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  31.98 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.47 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  32.09 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  31.46 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  30.9 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  31.05 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  31.33 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.74 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  31.7 
 
 		 423 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  31.57 
 
 		 427 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  31.82 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  30 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  32.32 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  29.74 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  34.08 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  31.47 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  27.96 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  27.96 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.96 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  27.96 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  27.96 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.15 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  27.96 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  27.96 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  29.92 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  27.23 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>