206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 414 aa  792    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  62.98 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  60.49 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  46.29 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  40.63 
 
 		 401 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  42.47 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  42.01 
 
 		 394 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.32 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  42.47 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  40.49 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.67 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  41.13 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  41.13 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  39.26 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  40.39 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  35.47 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  34.66 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  40.23 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  38.83 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.67 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  41.91 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  41.5 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.37 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.6 
 
 		 376 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  36.59 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  36.59 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  37.82 
 
 		 397 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  36.04 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  36.83 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  36.31 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  33.16 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  34.57 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  32.65 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  32.4 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  32.4 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  32.74 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  33.71 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  33.8 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  33.62 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  33.15 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  33.43 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  33.71 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  33.43 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  33.71 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  36.53 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  36.23 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  35.51 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  35.29 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  32.9 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  32.64 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  32.9 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  32.9 
 
 		 460 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  32.9 
 
 		 460 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  32.9 
 
 		 460 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  32.9 
 
 		 460 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  36.21 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  32.64 
 
 		 414 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  33.82 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.47 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  29.69 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  29.69 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.61 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  29.23 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.27 
 
 		 409 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  27.57 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  29.39 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  30.92 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  25.7 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  27.91 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  26.27 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.34 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.32 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  27.07 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  27.54 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  25.62 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.57 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.11 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  27.71 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  26.75 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  28.36 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  26.16 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.3 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  24.74 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.3 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.3 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  23.72 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  27.03 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  27.03 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  27.03 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  27.03 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  27.03 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  27.03 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  27.19 
 
 		 426 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  27.34 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  27.47 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>