203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3553 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  100 
 
 		 444 aa  900    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  65.76 
 
 		 437 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  65.98 
 
 		 437 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  48.62 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  56.57 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  54.16 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  46.17 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  44.39 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  45.31 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  44.39 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  43.97 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  43.88 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  46.36 
 
 		 442 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  45.31 
 
 		 455 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  42.57 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  43.42 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  37.89 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  37.93 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  35.39 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  34.01 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  36.07 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  32.7 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  30.09 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  30.28 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  29.5 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  29.1 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  30.06 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  29.34 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  29.77 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  28.74 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  33.42 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  27.07 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  29.31 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  29.55 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  29.12 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  29.11 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.32 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.29 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  29.63 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  28.71 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.51 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  31.46 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.57 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  29.13 
 
 		 426 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  27.41 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.42 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  30.19 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  27.75 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  28.29 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.88 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  27.75 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  27.25 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  27.05 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.92 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  28.49 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  27.86 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  26.82 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  30.05 
 
 		 425 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  30.21 
 
 		 425 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  30.05 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  26.72 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  29.73 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  24.38 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  29.43 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  28.85 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  25.49 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  25.49 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.76 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  25.49 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  25.24 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  25.55 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  25.25 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  28.06 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  25.12 
 
 		 433 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  27 
 
 		 405 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  26.94 
 
 		 405 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  23.02 
 
 		 420 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  23.02 
 
 		 420 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  26.7 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  28.85 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  23.95 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.3 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  26.85 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  28.02 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  30.03 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  26.78 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  25.3 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  25.25 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  26.54 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  25.55 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.57 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  26.2 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  27.59 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  26.6 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  25.55 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  26.25 
 
 		 417 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  26.25 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>