196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0389 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00279  deaminase  97.83 
 
 		 460 aa  940    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  97.83 
 
 		 460 aa  940    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  100 
 
 		 460 aa  961    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  97.83 
 
 		 460 aa  940    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  97.83 
 
 		 460 aa  940    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  84.75 
 
 		 459 aa  820    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  98.26 
 
 		 460 aa  943    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  99.03 
 
 		 414 aa  855    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  99.28 
 
 		 414 aa  857    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  62.75 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  60.7 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  47.81 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  47.11 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  42.86 
 
 		 413 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  42.72 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  42.72 
 
 		 413 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  42.36 
 
 		 413 aa  329  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  42.75 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  42.75 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  43 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  42.51 
 
 		 416 aa  322  7e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  42.51 
 
 		 414 aa  322  7e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  40.74 
 
 		 421 aa  299  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  40.25 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  40.25 
 
 		 414 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  40.49 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  40.25 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  34.99 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  34.13 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  35.47 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  32.72 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  32.67 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  30.37 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.43 
 
 		 376 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  33.66 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.37 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  31.55 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  32.3 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  32.3 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  31.99 
 
 		 399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  30.69 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  33.02 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  32.3 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  29.14 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.81 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  33.64 
 
 		 405 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  32.71 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  33.82 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.61 
 
 		 413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  31.33 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  32.29 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  31.07 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  31.25 
 
 		 394 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  32.29 
 
 		 394 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  32.29 
 
 		 394 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  31.25 
 
 		 394 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  32.57 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.56 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.83 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  32.17 
 
 		 394 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.77 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  26.17 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.2 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  25.46 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  24.74 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  24.75 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  24.57 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  24.08 
 
 		 409 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  23.87 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  24.27 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  24.27 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  24.27 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  24.27 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  24.27 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  24.27 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  21.81 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  26.85 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.23 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  24.73 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.29 
 
 		 424 aa  91.3  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.38 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.41 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.36 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  27.18 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.4 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.91 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.4 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.27 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  23.81 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.4 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  26.63 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  25.87 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.51 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  26.62 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  27.14 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  26.05 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>