More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2899 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  100 
 
 
482 aa  934    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  38.34 
 
 
466 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  36.95 
 
 
445 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  35.9 
 
 
451 aa  226  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  39.48 
 
 
428 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  39.68 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  38.65 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  33.63 
 
 
451 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  38.81 
 
 
461 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  34.51 
 
 
501 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  36.82 
 
 
490 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  33.88 
 
 
480 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  38.48 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  32.69 
 
 
504 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  35.43 
 
 
466 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  33.41 
 
 
459 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  33.41 
 
 
451 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  35.58 
 
 
451 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  36.81 
 
 
520 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  33.18 
 
 
487 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  35.88 
 
 
466 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2253  amidohydrolase  26.33 
 
 
437 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  26.7 
 
 
432 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  25.81 
 
 
431 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25.32 
 
 
436 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  31.5 
 
 
453 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.43 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.4 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  29.31 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.51 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  29.29 
 
 
656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 
464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.53 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  29.67 
 
 
477 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  22.62 
 
 
422 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  26.8 
 
 
451 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  28.98 
 
 
447 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  27.75 
 
 
462 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.04 
 
 
447 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  29.68 
 
 
457 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08593  chlorohydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00460)  26.48 
 
 
465 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.19 
 
 
444 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.94 
 
 
445 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  22.75 
 
 
422 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.92 
 
 
430 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.96 
 
 
441 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  30.26 
 
 
451 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  29.35 
 
 
476 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  29.48 
 
 
448 aa  103  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  21.44 
 
 
422 aa  103  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.06 
 
 
484 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  29.76 
 
 
460 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  28.27 
 
 
509 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.17 
 
 
433 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.06 
 
 
451 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  22.12 
 
 
422 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  25.87 
 
 
431 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.36 
 
 
441 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17350  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.81 
 
 
528 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0530405  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.35 
 
 
452 aa  100  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  28.57 
 
 
663 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.02 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.21 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  29.05 
 
 
444 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.71 
 
 
446 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  23.26 
 
 
431 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  29.38 
 
 
476 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.53 
 
 
434 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  29.39 
 
 
432 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.34 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  20.88 
 
 
420 aa  95.9  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.79 
 
 
434 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  24.62 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.92 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.56 
 
 
469 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5111  amidohydrolase  32 
 
 
479 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0323236  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.46 
 
 
444 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  28.34 
 
 
445 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  29.59 
 
 
429 aa  94  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  28.54 
 
 
460 aa  93.6  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  27.8 
 
 
440 aa  93.6  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  28.13 
 
 
476 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.27 
 
 
448 aa  93.2  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  26.3 
 
 
462 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  26.82 
 
 
444 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  25.39 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  28.17 
 
 
473 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  23.11 
 
 
434 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  24.28 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  19.31 
 
 
428 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  28.47 
 
 
481 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  30.47 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.4 
 
 
470 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.32 
 
 
459 aa  90.5  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  26.46 
 
 
491 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  26.65 
 
 
468 aa  90.5  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  27.11 
 
 
663 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.49 
 
 
476 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.4 
 
 
470 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>