More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1785 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  924    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  47.13 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  38.72 
 
 		 466 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  36.9 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  37.08 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  36.28 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  37.23 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  36.4 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  33.27 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  32.95 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  32.52 
 
 		 501 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  31.47 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  31.25 
 
 		 487 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  33.64 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  31.56 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  32.67 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  29.55 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  32.51 
 
 		 520 aa  156  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  31.78 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  33.18 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  30.54 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.4 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  26.89 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  27.08 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2387  amidohydrolase  29.09 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.6 
 
 		 439 aa  117  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.27 
 
 		 468 aa  117  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  25.23 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.87 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2475  amidohydrolase  28.63 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.73 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2253  amidohydrolase  25.22 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0417  amidohydrolase  27.42 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  23.04 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.51 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.49 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  29.47 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  28.35 
 
 		 447 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.9 
 
 		 439 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.69 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.73 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  28.57 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  27.04 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.48 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.53 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  27.93 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.66 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.73 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.95 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.6 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  25.4 
 
 		 443 aa  99.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  27.05 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  26.99 
 
 		 428 aa  97.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  28.96 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25.66 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  26.23 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  25.65 
 
 		 656 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  25.68 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  29.33 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  23.64 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25.52 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  25.88 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  31.66 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.29 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  27.09 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  25.23 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  25.23 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  25.69 
 
 		 466 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.53 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.47 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  23.65 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  24.77 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  24.77 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  24.77 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  23.33 
 
 		 431 aa  91.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  25.27 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.27 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  24.54 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.37 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  25.69 
 
 		 663 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.54 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  27.53 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  28.17 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  26.25 
 
 		 442 aa  90.1  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  23.97 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  24.31 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  23.23 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  22.83 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  25.45 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  24.31 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.06 
 
 		 444 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  28.11 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.41 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  23.92 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.31 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2064  amidohydrolase  25.75 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.11 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.02 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  24.22 
 
 		 431 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>