More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2387 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2475  amidohydrolase  83.61 
 
 
490 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2387  amidohydrolase  100 
 
 
483 aa  989    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0417  amidohydrolase  76.6 
 
 
483 aa  765    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  36.94 
 
 
491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  30.62 
 
 
439 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  28.76 
 
 
468 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  29.35 
 
 
434 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  29.21 
 
 
447 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  28.69 
 
 
440 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2138  amidohydrolase  31.35 
 
 
469 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  30.57 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.24 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  27.03 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  27.54 
 
 
436 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  26.3 
 
 
432 aa  161  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.45 
 
 
445 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  28.3 
 
 
663 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.63 
 
 
441 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.95 
 
 
431 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.47 
 
 
431 aa  153  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 
464 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.56 
 
 
434 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  30.98 
 
 
430 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  28.27 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.21 
 
 
484 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.37 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.21 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  27.45 
 
 
663 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  24.62 
 
 
431 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.91 
 
 
656 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.91 
 
 
431 aa  143  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.72 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0817  amidohydrolase  29.8 
 
 
464 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.19 
 
 
433 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  26.37 
 
 
440 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  28.98 
 
 
477 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  25.54 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.58 
 
 
470 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.58 
 
 
470 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  26.09 
 
 
435 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.58 
 
 
470 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.81 
 
 
441 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  26.65 
 
 
441 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.23 
 
 
470 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  26.94 
 
 
435 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  26.94 
 
 
435 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  26.74 
 
 
435 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  26.29 
 
 
435 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  26.83 
 
 
461 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.11 
 
 
465 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  26.74 
 
 
435 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  26.29 
 
 
435 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.77 
 
 
470 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  27.17 
 
 
448 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  26.29 
 
 
435 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.86 
 
 
452 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.92 
 
 
500 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.14 
 
 
476 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.77 
 
 
470 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.92 
 
 
476 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.95 
 
 
428 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  23.97 
 
 
444 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  24.9 
 
 
660 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.98 
 
 
470 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.63 
 
 
444 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.84 
 
 
431 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.77 
 
 
470 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.48 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  26.08 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.21 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  23.72 
 
 
434 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  27.16 
 
 
466 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.54 
 
 
457 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.32 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.32 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  27.76 
 
 
432 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.7 
 
 
449 aa  118  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  25.89 
 
 
441 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  25.89 
 
 
441 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.54 
 
 
444 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  26.07 
 
 
422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  27.43 
 
 
478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  27.46 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.65 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.71 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.79 
 
 
459 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.95 
 
 
452 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.27 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  21.52 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.57 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  28.88 
 
 
459 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  27.03 
 
 
432 aa  110  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.22 
 
 
447 aa  110  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  30.04 
 
 
474 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.55 
 
 
454 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  28.41 
 
 
451 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.91 
 
 
447 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5111  amidohydrolase  26.88 
 
 
479 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0323236  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.91 
 
 
447 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>