More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0817 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0817  amidohydrolase  100 
 
 
464 aa  913    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2138  amidohydrolase  46.75 
 
 
469 aa  363  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  33.48 
 
 
447 aa  212  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.01 
 
 
445 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  34.76 
 
 
442 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  33.84 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  30.66 
 
 
464 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  31.5 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.15 
 
 
432 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.21 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  30.79 
 
 
455 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.49 
 
 
484 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.49 
 
 
451 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  31.05 
 
 
440 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.99 
 
 
434 aa  177  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  28.57 
 
 
434 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  31.25 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  32.89 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.55 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  29.5 
 
 
433 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.14 
 
 
442 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  27.11 
 
 
431 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.28 
 
 
444 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  29.05 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  31.98 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5111  amidohydrolase  32.39 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0323236  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.74 
 
 
443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.71 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  28.57 
 
 
479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  27.64 
 
 
431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  31.81 
 
 
491 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.18 
 
 
439 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  26.35 
 
 
436 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.18 
 
 
441 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  28.15 
 
 
468 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  29.21 
 
 
435 aa  157  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  30.14 
 
 
442 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.86 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  30.35 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2387  amidohydrolase  30.49 
 
 
483 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  29.34 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.77 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0654  amidohydrolase  27.16 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.91 
 
 
444 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  27.62 
 
 
462 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  29.63 
 
 
660 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  26.38 
 
 
444 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  28.28 
 
 
431 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  30.9 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.97 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  28.17 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  31.69 
 
 
663 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  29.65 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.35 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  28.19 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.29 
 
 
428 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  31.77 
 
 
663 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  29.28 
 
 
458 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  29.62 
 
 
441 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2475  amidohydrolase  29.87 
 
 
490 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  29.62 
 
 
441 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  29.72 
 
 
440 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  24.38 
 
 
420 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  26.62 
 
 
469 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.49 
 
 
440 aa  143  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1366  amidohydrolase  24.32 
 
 
459 aa  143  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.376571  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  31.32 
 
 
483 aa  143  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  26.51 
 
 
434 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.25 
 
 
447 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.75 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  31.94 
 
 
656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  27.98 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  32.66 
 
 
432 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.27 
 
 
447 aa  140  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.27 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.11 
 
 
431 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  28.47 
 
 
435 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.72 
 
 
439 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  28.47 
 
 
435 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.74 
 
 
446 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  28.47 
 
 
435 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.54 
 
 
449 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  26.46 
 
 
426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  28.47 
 
 
435 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.41 
 
 
441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  28.47 
 
 
435 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  28.47 
 
 
435 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.48 
 
 
439 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  28.44 
 
 
441 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  33.16 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  29.51 
 
 
413 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4080  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.98 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.55583  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2068  amidohydrolase  29.57 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  25.41 
 
 
435 aa  134  3e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  29.65 
 
 
443 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  28.23 
 
 
435 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  28.23 
 
 
435 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.69 
 
 
442 aa  133  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  28.43 
 
 
435 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  29.41 
 
 
448 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>