More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0048 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  70.48 
 
 
480 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  100 
 
 
501 aa  1019    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  70 
 
 
504 aa  636    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  37.86 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  36.04 
 
 
451 aa  230  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  36.4 
 
 
419 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  34.02 
 
 
451 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  34.3 
 
 
445 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  32.32 
 
 
466 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  35.22 
 
 
428 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  32.52 
 
 
459 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  33.33 
 
 
490 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  34.51 
 
 
482 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  34.69 
 
 
456 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  31.2 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  32 
 
 
451 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  32.15 
 
 
414 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  31.6 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  30.82 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  28.66 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  24.3 
 
 
462 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  28.98 
 
 
487 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25.29 
 
 
432 aa  123  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  24.72 
 
 
434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.16 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  27.29 
 
 
445 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  26.14 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.76 
 
 
432 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08593  chlorohydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00460)  28.47 
 
 
465 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  24.44 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  24.57 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  25.5 
 
 
468 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.22 
 
 
431 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.65 
 
 
440 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  26.2 
 
 
439 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  24 
 
 
440 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.91 
 
 
431 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25 
 
 
465 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25 
 
 
465 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  24.55 
 
 
431 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  23.86 
 
 
469 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  22.69 
 
 
428 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.91 
 
 
430 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  24.66 
 
 
442 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.46 
 
 
457 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.21 
 
 
470 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  24.78 
 
 
440 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  27.96 
 
 
443 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.21 
 
 
470 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  22.68 
 
 
431 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.21 
 
 
470 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.81 
 
 
447 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.54 
 
 
454 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  25 
 
 
431 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.81 
 
 
470 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  26.76 
 
 
444 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.42 
 
 
452 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.35 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.27 
 
 
470 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.88 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.84 
 
 
470 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.95 
 
 
452 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  24.67 
 
 
440 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  25.73 
 
 
477 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.72 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  30.37 
 
 
444 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.01 
 
 
484 aa  97.1  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.63 
 
 
470 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.01 
 
 
451 aa  96.7  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.1 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  23.21 
 
 
436 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.25 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  25.95 
 
 
453 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  27.25 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  22.79 
 
 
444 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.11 
 
 
433 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.21 
 
 
470 aa  93.6  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.83 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.57 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.54 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  27.48 
 
 
460 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  27.58 
 
 
478 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  26.55 
 
 
462 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  26.62 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25 
 
 
476 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  24.55 
 
 
660 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  27.67 
 
 
448 aa  90.9  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.79 
 
 
500 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.37 
 
 
476 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  22.5 
 
 
420 aa  90.5  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  30.07 
 
 
453 aa  90.5  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  27.53 
 
 
483 aa  90.1  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  26.43 
 
 
466 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  24.68 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.5 
 
 
446 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2655  selenium metabolism protein SsnA  21.65 
 
 
443 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.02 
 
 
469 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  26.58 
 
 
442 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.33 
 
 
449 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  28.08 
 
 
451 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>