More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4731 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  100 
 
 
490 aa  965    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  44.54 
 
 
466 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  41.86 
 
 
451 aa  310  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  39.62 
 
 
445 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  39.35 
 
 
419 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  37.45 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  36.99 
 
 
414 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  40.53 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  34.53 
 
 
451 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  32.85 
 
 
459 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  35.48 
 
 
456 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  33.77 
 
 
501 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  37.04 
 
 
482 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  32.34 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  32.38 
 
 
451 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  31.76 
 
 
504 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  33.91 
 
 
451 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  31.61 
 
 
487 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  33.7 
 
 
461 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  32.42 
 
 
520 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  30.18 
 
 
466 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.93 
 
 
441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.73 
 
 
432 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.71 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.46 
 
 
445 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.89 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  27.22 
 
 
455 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.39 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  27.63 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  26.54 
 
 
443 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  23.26 
 
 
434 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  26.86 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  28.18 
 
 
477 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.81 
 
 
452 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.77 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  23.63 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  25.62 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  23.83 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.35 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  23.22 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  25.74 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.57 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.57 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.57 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  27.41 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.1 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.43 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.68 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.58 
 
 
451 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  23.98 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.19 
 
 
470 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.48 
 
 
470 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.58 
 
 
484 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.47 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  26.54 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.75 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.75 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.41 
 
 
469 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  24.14 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  25.71 
 
 
476 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  23.43 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1672  selenium metabolism protein SsnA  25.37 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  25.64 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4530  amidohydrolase  27.05 
 
 
488 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.14 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  25.41 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  23.02 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.05 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  20.22 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.05 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  22.27 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.17 
 
 
470 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  24.95 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.8 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.59 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.31 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  24.19 
 
 
663 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0675  amidohydrolase  26.67 
 
 
465 aa  73.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0433934  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  24.84 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 
464 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  27.44 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  21.48 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  23.67 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  24.09 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  21.76 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.65 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  28.67 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.65 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  24.09 
 
 
663 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2475  amidohydrolase  24.08 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1737  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  24.17 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.58 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  28.03 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2655  selenium metabolism protein SsnA  21.13 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  23.92 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  27.74 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  24.52 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  24.88 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.18 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3147  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.15 
 
 
495 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>