147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4915 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  80.77 
 
 		 390 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  81.03 
 
 		 390 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  81.03 
 
 		 390 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  80.51 
 
 		 390 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  99.49 
 
 		 390 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 		 390 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 		 390 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  99.74 
 
 		 390 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 		 390 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  48.32 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  46.02 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  46.25 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  46.75 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  45.91 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  44.13 
 
 		 377 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 		 377 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  45.71 
 
 		 390 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  44.42 
 
 		 391 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  42.33 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  43.73 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  43.68 
 
 		 363 aa  279  7e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  40.83 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  41.22 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  41.43 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  39.26 
 
 		 402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  41.49 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  36.19 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  25.97 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0289  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.11 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.48 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3402  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.65 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000022034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  32.4 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  24.54 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.58 
 
 		 439 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  29.73 
 
 		 908 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  34.21 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.94 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  34.69 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.19 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  21.79 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.4 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  23.24 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.25 
 
 		 552 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  38.71 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  46.81 
 
 		 556 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  38.71 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  46.67 
 
 		 596 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  29.77 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  35.06 
 
 		 569 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.93 
 
 		 520 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  28.7 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  37.7 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.21 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  37.5 
 
 		 585 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1005 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  47.06 
 
 		 533 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.53 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  24.24 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1113  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.03 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.73 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2144  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  22.7 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  29.25 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.33 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0184  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.02 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0749437  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.73 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.61 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  33.73 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  30 
 
 		 541 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.25 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.33 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  39.34 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  42.31 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  37.7 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  37.31 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  31.03 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.68 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  38.81 
 
 		 1062 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  30 
 
 		 1018 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  38.89 
 
 		 541 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>