95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1352 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
377 aa  765    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  57.59 
 
 
391 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  49.87 
 
 
391 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  46.79 
 
 
388 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  43.49 
 
 
390 aa  316  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  44.85 
 
 
402 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  43.49 
 
 
390 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 
390 aa  315  8e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  43.23 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 
390 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  44.13 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  44.13 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  44.13 
 
 
390 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  43.86 
 
 
390 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  43.86 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  41.38 
 
 
376 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  42.26 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  38.92 
 
 
390 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  40.15 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  39.13 
 
 
389 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  41.99 
 
 
378 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.62 
 
 
395 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  38.62 
 
 
389 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  43.13 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  39.8 
 
 
393 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  40.69 
 
 
376 aa  266  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  40.42 
 
 
377 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  39.64 
 
 
389 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  38.87 
 
 
389 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  38.87 
 
 
389 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  38.87 
 
 
389 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  41.9 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  38.32 
 
 
390 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  24.03 
 
 
576 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  48.84 
 
 
454 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  33.98 
 
 
623 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  34.85 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  26.93 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  32.48 
 
 
641 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  45.24 
 
 
472 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  24.59 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  24.04 
 
 
424 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  36.84 
 
 
479 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  22.58 
 
 
1029 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2544  amidohydrolase  24.32 
 
 
459 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3701  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.96 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0437627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  39.68 
 
 
457 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  28.09 
 
 
479 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  22.33 
 
 
1020 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.09 
 
 
447 aa  46.6  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  22.33 
 
 
1029 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  31.03 
 
 
475 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  33.1 
 
 
459 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0119  dihydropyrimidinase  37.7 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4364  Allantoinase  35 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.95 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  23.34 
 
 
988 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  22.88 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2769  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  29.17 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  22.41 
 
 
434 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  35.09 
 
 
469 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  28.24 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  32.98 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  37.5 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  29.17 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  21.41 
 
 
597 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  24.32 
 
 
473 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  26.8 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  31.69 
 
 
447 aa  43.5  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  47.06 
 
 
489 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  29.79 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  35.85 
 
 
460 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  22.22 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  31.96 
 
 
404 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  24.22 
 
 
425 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 
444 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  32.97 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  27.54 
 
 
429 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4487  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  29.27 
 
 
396 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  22.64 
 
 
451 aa  42.7  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  27.52 
 
 
908 aa  42.7  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  28.3 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  28.3 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  28.3 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  39.02 
 
 
451 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  28.3 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  28.3 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  28.3 
 
 
465 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  28.3 
 
 
465 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  28.3 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>