45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1999 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  98.71 
 
 		 389 aa  781    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  98.46 
 
 		 389 aa  778    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 		 389 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  96.4 
 
 		 389 aa  747    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  61.86 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  48.14 
 
 		 376 aa  332  6e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  44.87 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  44.5 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  44.47 
 
 		 389 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  42.97 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  42.16 
 
 		 402 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  44.44 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 		 379 aa  296  5e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  40.2 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 390 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  42.4 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  42.67 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  39.53 
 
 		 377 aa  288  9e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  40.31 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.58 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  39.69 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 390 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 390 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  40.05 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  39.28 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  38.87 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  38.93 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  39.1 
 
 		 393 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  27.27 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  23 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  23 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3701  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.5 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0437627  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0813  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.21 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0482974  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3853  hypothetical protein  62.5 
 
 		 34 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22930  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.21 
 
 		 379 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>