168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2207 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 		 391 aa  791    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  57.59 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  49.49 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  46.53 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  44.19 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  44.42 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  44.42 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  44.42 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  44.16 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  44.16 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  43.64 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  43.64 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  43.64 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  43.12 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  43.38 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  43.12 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  43.12 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  43.12 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  46.34 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  43.38 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  45.96 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  42.39 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  42.64 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  42.38 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  42.51 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  40.05 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  41.03 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  40.05 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  40.05 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  43.6 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  41.91 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  40.41 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  44.68 
 
 		 363 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.07 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  40.73 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  38.87 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  41.37 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  41.51 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  22.33 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.07 
 
 		 680 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  21.17 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  34.48 
 
 		 479 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3402  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.64 
 
 		 374 aa  53.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000022034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  22.22 
 
 		 988 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  24.87 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  34.48 
 
 		 471 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  47.73 
 
 		 489 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  21.5 
 
 		 426 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  27.27 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  21.39 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  21.37 
 
 		 1020 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  22.25 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  29.31 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  36.73 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  35.48 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  30.23 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  35.48 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  36.73 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  36.73 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  35.29 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.13 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  41.86 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  43.06 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  31.03 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  41.94 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  43.06 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  44.19 
 
 		 484 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  37.93 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.82 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  31.5 
 
 		 1005 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  42.55 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  21.92 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  28.17 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.81 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  40.35 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  29.87 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  24.58 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  41.86 
 
 		 484 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08593  chlorohydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00460)  35.62 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  20.1 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  26.99 
 
 		 576 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  41.79 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  41.46 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  39.58 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  24.18 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  39.39 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  22.82 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  38.71 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  39.58 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  39.58 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  33.93 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  40.37 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  42.03 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.7 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  38.64 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  24.63 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  36.17 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  33.33 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  23.42 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>