223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4704 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  100 
 
 
424 aa  850    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  50.85 
 
 
429 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  41.43 
 
 
411 aa  245  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  42.28 
 
 
394 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  38.71 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.12 
 
 
407 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.72 
 
 
401 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.3 
 
 
426 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.25 
 
 
430 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.31 
 
 
445 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  34.97 
 
 
405 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.99 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.13 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  31.08 
 
 
421 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.78 
 
 
400 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.07 
 
 
407 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.64 
 
 
426 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.33 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.59 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.77 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.79 
 
 
428 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.85 
 
 
440 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.02 
 
 
426 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.64 
 
 
444 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  30.94 
 
 
422 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.59 
 
 
423 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.54 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.61 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  33.66 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.49 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.31 
 
 
419 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29 
 
 
433 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.32 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  33.25 
 
 
408 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  33.25 
 
 
408 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  33.25 
 
 
408 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.41 
 
 
424 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  30.77 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.24 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  30.53 
 
 
404 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.32 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  30.36 
 
 
403 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.18 
 
 
433 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  31.12 
 
 
429 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.42 
 
 
417 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  30.63 
 
 
402 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.42 
 
 
417 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.42 
 
 
417 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.64 
 
 
414 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.38 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.83 
 
 
437 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.27 
 
 
432 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.2 
 
 
444 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  28.93 
 
 
470 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  28.88 
 
 
409 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.1 
 
 
438 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  33.78 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  28.96 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  29.51 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  25.72 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  29.18 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.43 
 
 
428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  27.91 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  30.1 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.53 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  25.26 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  32.46 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.96 
 
 
459 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.21 
 
 
432 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.37 
 
 
407 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  24.74 
 
 
412 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  27.9 
 
 
419 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  30.22 
 
 
417 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.27 
 
 
448 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.3 
 
 
420 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.64 
 
 
419 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  30.62 
 
 
428 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  27.66 
 
 
425 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  27.86 
 
 
413 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  27.63 
 
 
411 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.66 
 
 
411 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  27.74 
 
 
411 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  27.27 
 
 
478 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  26.59 
 
 
396 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.12 
 
 
413 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  25.89 
 
 
390 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.12 
 
 
413 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  25.99 
 
 
428 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.29 
 
 
426 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  26.92 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  26.7 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  28.97 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  26.15 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.19 
 
 
421 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  29.17 
 
 
414 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  27.58 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  27.11 
 
 
440 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>