95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0083 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  58.01 
 
 
583 aa  729    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  100 
 
 
597 aa  1235    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  57.84 
 
 
583 aa  722    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  58.01 
 
 
583 aa  728    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  57.84 
 
 
583 aa  727    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  58.68 
 
 
584 aa  753    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  56.16 
 
 
584 aa  711    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.48 
 
 
567 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  46.48 
 
 
567 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.31 
 
 
567 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  46.31 
 
 
567 aa  520  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  44.98 
 
 
582 aa  513  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  42.69 
 
 
566 aa  504  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  42.76 
 
 
568 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.78 
 
 
569 aa  485  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  42.83 
 
 
571 aa  476  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.65 
 
 
570 aa  477  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  41.37 
 
 
566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  41.26 
 
 
578 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.44 
 
 
570 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  41.65 
 
 
566 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  39.9 
 
 
565 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.81 
 
 
566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  41.03 
 
 
568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  39.03 
 
 
570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.52 
 
 
552 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.85 
 
 
558 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.73 
 
 
556 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  34.19 
 
 
555 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.12 
 
 
561 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.9 
 
 
566 aa  346  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.01 
 
 
561 aa  339  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.68 
 
 
561 aa  332  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.86 
 
 
562 aa  328  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.65 
 
 
566 aa  327  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  33.17 
 
 
549 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  29.53 
 
 
572 aa  289  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.73 
 
 
542 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.28 
 
 
548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.98 
 
 
548 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.6 
 
 
548 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.77 
 
 
548 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.33 
 
 
543 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.91 
 
 
543 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.69 
 
 
432 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 
426 aa  55.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 
429 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 
424 aa  50.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.06 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  46.38 
 
 
407 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 
429 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 
425 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  35.94 
 
 
425 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  46.88 
 
 
396 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  30.51 
 
 
435 aa  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 
425 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  40.91 
 
 
431 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  36.92 
 
 
475 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  25 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  34.67 
 
 
420 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  39.68 
 
 
426 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  33.33 
 
 
433 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  36.76 
 
 
1005 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  37.31 
 
 
471 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  39.06 
 
 
427 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.51 
 
 
430 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  37.5 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  38.1 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  39.39 
 
 
431 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  38.1 
 
 
474 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  39.06 
 
 
460 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  32.84 
 
 
463 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  34.38 
 
 
395 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  41.67 
 
 
430 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  34.38 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.38 
 
 
420 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.86 
 
 
436 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  34.85 
 
 
395 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  32.89 
 
 
424 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  35.82 
 
 
428 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  40.85 
 
 
461 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  36.36 
 
 
436 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.81 
 
 
429 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  43.08 
 
 
377 aa  44.3  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  33.33 
 
 
412 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  36.51 
 
 
426 aa  44.3  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  38.71 
 
 
479 aa  44.3  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  35.94 
 
 
414 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  34.67 
 
 
479 aa  44.3  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.94 
 
 
441 aa  43.9  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.92 
 
 
433 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.31 
 
 
424 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>