74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0619 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  69.31 
 
 		 569 aa  843    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  66.9 
 
 		 570 aa  785    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  67.37 
 
 		 570 aa  822    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  66.26 
 
 		 568 aa  805    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  100 
 
 		 568 aa  1179    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  65.61 
 
 		 571 aa  781    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  72.26 
 
 		 566 aa  884    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  67.25 
 
 		 578 aa  808    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  77.02 
 
 		 570 aa  941    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  53.25 
 
 		 567 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  53.43 
 
 		 567 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  53.43 
 
 		 567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  52.72 
 
 		 567 aa  590  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  46.89 
 
 		 566 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  47.06 
 
 		 583 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.27 
 
 		 583 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.37 
 
 		 583 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.19 
 
 		 584 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  46.77 
 
 		 566 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  45.07 
 
 		 583 aa  501  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  45.31 
 
 		 582 aa  500  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.46 
 
 		 584 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  45.55 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  42.76 
 
 		 597 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.77 
 
 		 566 aa  465  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  37.39 
 
 		 555 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.57 
 
 		 552 aa  360  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.07 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.46 
 
 		 561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.54 
 
 		 566 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.84 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.68 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.57 
 
 		 562 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.33 
 
 		 561 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.56 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  38.9 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  33.8 
 
 		 572 aa  317  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.82 
 
 		 548 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.22 
 
 		 548 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.27 
 
 		 548 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.73 
 
 		 542 aa  293  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.22 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.59 
 
 		 543 aa  290  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.78 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  34.11 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  48.44 
 
 		 425 aa  50.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  30.84 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  41.18 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.4 
 
 		 419 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  46.27 
 
 		 446 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  41.54 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  37.31 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  44.64 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  33.65 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.84 
 
 		 434 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  28.69 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.62 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  42.65 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  32.56 
 
 		 411 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  39.68 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 425 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  38.16 
 
 		 413 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  40 
 
 		 479 aa  44.3  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  42.19 
 
 		 427 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.31 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  38.16 
 
 		 570 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 433 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  45.45 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  31.13 
 
 		 411 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  35.44 
 
 		 479 aa  43.5  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 425 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>