81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1982 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  75.53 
 
 		 570 aa  907    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  63.73 
 
 		 570 aa  775    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  65.67 
 
 		 570 aa  780    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  72.26 
 
 		 568 aa  884    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  67.49 
 
 		 568 aa  819    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  65.91 
 
 		 571 aa  789    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  100 
 
 		 566 aa  1176    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  66.61 
 
 		 578 aa  806    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  69.31 
 
 		 569 aa  848    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  52.55 
 
 		 567 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  52.88 
 
 		 567 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  52.01 
 
 		 567 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  52.9 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  47.33 
 
 		 566 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  45.91 
 
 		 582 aa  512  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  45.41 
 
 		 583 aa  514  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  43.66 
 
 		 583 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.49 
 
 		 583 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.66 
 
 		 583 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  44.04 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.69 
 
 		 584 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.35 
 
 		 584 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  44.05 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  41.37 
 
 		 597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.79 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  38.34 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.79 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.7 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.23 
 
 		 552 aa  365  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.62 
 
 		 562 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  40.24 
 
 		 549 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.36 
 
 		 561 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.3 
 
 		 561 aa  352  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.6 
 
 		 566 aa  352  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.45 
 
 		 566 aa  346  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.31 
 
 		 561 aa  343  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  33.45 
 
 		 572 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.24 
 
 		 548 aa  316  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.07 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.12 
 
 		 548 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.77 
 
 		 543 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.95 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.69 
 
 		 548 aa  300  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.81 
 
 		 548 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  47.06 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.18 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  46.15 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  29.51 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.67 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  37.84 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  37.5 
 
 		 424 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  35.94 
 
 		 427 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  43.75 
 
 		 431 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  34.33 
 
 		 405 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  39.71 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  32.76 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  46.15 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  32.76 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.82 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  37.66 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  32.76 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  26.21 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.43 
 
 		 454 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.68 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.68 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  32.99 
 
 		 430 aa  45.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  32.67 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  39.06 
 
 		 425 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  35.82 
 
 		 420 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  37.84 
 
 		 461 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  35.19 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  29.17 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.46 
 
 		 395 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3519  dihydropyrimidinase  27.15 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.96 
 
 		 425 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.96 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  30.48 
 
 		 472 aa  43.5  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  41.18 
 
 		 577 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  26.09 
 
 		 467 aa  43.5  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.3 
 
 		 427 aa  43.5  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>