51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1663 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  73.36 
 
 
555 aa  862    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  68.9 
 
 
556 aa  811    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  59.6 
 
 
561 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  58.04 
 
 
566 aa  673    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  59.09 
 
 
562 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  100 
 
 
558 aa  1162    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  60.4 
 
 
566 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  57.22 
 
 
561 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  59.41 
 
 
561 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  57.56 
 
 
549 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  50.79 
 
 
572 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.37 
 
 
542 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.83 
 
 
552 aa  451  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.23 
 
 
548 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.78 
 
 
548 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.46 
 
 
543 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.96 
 
 
548 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.6 
 
 
548 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  40.39 
 
 
566 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  39.55 
 
 
583 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.22 
 
 
543 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.37 
 
 
583 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.72 
 
 
583 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.61 
 
 
567 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  39.19 
 
 
583 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  40.07 
 
 
567 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.89 
 
 
567 aa  399  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  40.43 
 
 
567 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.25 
 
 
584 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  37.79 
 
 
566 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.63 
 
 
584 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  37.39 
 
 
582 aa  379  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  35.85 
 
 
597 aa  375  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.6 
 
 
570 aa  375  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  36.52 
 
 
566 aa  371  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  38.21 
 
 
578 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.82 
 
 
570 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  36.71 
 
 
568 aa  362  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  36.12 
 
 
565 aa  360  4e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  37.07 
 
 
568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  38.21 
 
 
571 aa  356  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.93 
 
 
566 aa  354  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  35.78 
 
 
570 aa  347  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.13 
 
 
569 aa  343  5e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  55.17 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  46.88 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.54 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  41.27 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.51 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.46 
 
 
436 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  31.73 
 
 
586 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>