80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0245 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  65.91 
 
 		 570 aa  798    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  61.71 
 
 		 570 aa  734    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  100 
 
 		 570 aa  1192    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  66.9 
 
 		 568 aa  805    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  63.4 
 
 		 571 aa  748    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  65.67 
 
 		 566 aa  800    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  64.45 
 
 		 568 aa  768    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  62.87 
 
 		 578 aa  757    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  61.62 
 
 		 569 aa  754    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  51.84 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.14 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  51.14 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  51.23 
 
 		 567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  48.13 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  46.65 
 
 		 566 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.25 
 
 		 584 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.77 
 
 		 584 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  45.58 
 
 		 566 aa  525  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  45.66 
 
 		 583 aa  519  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  45.83 
 
 		 583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.66 
 
 		 583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.83 
 
 		 583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  45.62 
 
 		 565 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  43.65 
 
 		 597 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.13 
 
 		 566 aa  472  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  39.78 
 
 		 555 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.6 
 
 		 558 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.44 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.79 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.57 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.74 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.34 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.66 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.32 
 
 		 566 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.28 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  38.66 
 
 		 549 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  31.79 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.14 
 
 		 548 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.88 
 
 		 542 aa  310  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.75 
 
 		 548 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.88 
 
 		 543 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.4 
 
 		 548 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.04 
 
 		 548 aa  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.69 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  45.31 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  35.51 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  40.22 
 
 		 471 aa  50.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.18 
 
 		 432 aa  50.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  28.92 
 
 		 435 aa  47.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  46.97 
 
 		 579 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  39.39 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  37.33 
 
 		 416 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  46.77 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.62 
 
 		 426 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  45.9 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  29.46 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  42.19 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  43.75 
 
 		 578 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  33.33 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  31.4 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  37.84 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  33.33 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  34.25 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  38.1 
 
 		 588 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  46.88 
 
 		 578 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  38.1 
 
 		 700 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  38.1 
 
 		 418 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  38.1 
 
 		 588 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  38.1 
 
 		 699 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  38.1 
 
 		 584 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  38.1 
 
 		 584 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.27 
 
 		 425 aa  44.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 		 425 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  35.8 
 
 		 570 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  39.06 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  40.62 
 
 		 425 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  40.91 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  42.19 
 
 		 427 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  36.92 
 
 		 395 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>