100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1826 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  74.59 
 
 		 543 aa  806    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  99.27 
 
 		 548 aa  1109    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  97.81 
 
 		 548 aa  1097    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 548 aa  1115    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  79.93 
 
 		 548 aa  909    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  72.94 
 
 		 543 aa  807    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.74 
 
 		 542 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  46.36 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.07 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  44.61 
 
 		 555 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.87 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.17 
 
 		 561 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.95 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.64 
 
 		 566 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.39 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.6 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.96 
 
 		 556 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  43.3 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.85 
 
 		 552 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  37.32 
 
 		 566 aa  324  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.02 
 
 		 567 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.84 
 
 		 567 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  35.66 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  34.81 
 
 		 566 aa  299  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  35.3 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.97 
 
 		 570 aa  296  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  33.99 
 
 		 570 aa  294  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  35.27 
 
 		 568 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  35.89 
 
 		 578 aa  292  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.34 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.4 
 
 		 570 aa  279  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  33.09 
 
 		 565 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 568 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 583 aa  276  6e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  34.98 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.62 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.09 
 
 		 583 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 566 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  30.52 
 
 		 583 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  32.14 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.24 
 
 		 584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  30.77 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.02 
 
 		 566 aa  251  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.15 
 
 		 584 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  39.78 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  40.62 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  47.54 
 
 		 485 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  39.06 
 
 		 423 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  39.06 
 
 		 446 aa  50.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  47.54 
 
 		 485 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  42.19 
 
 		 439 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  42.19 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  45.9 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  45.76 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  34.34 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  35.56 
 
 		 489 aa  47.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  37.5 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  35.56 
 
 		 489 aa  47.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  37.5 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.67 
 
 		 422 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  39.06 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  43.86 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  47.46 
 
 		 422 aa  47  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.68 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  36.19 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.46 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  39.06 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  37.5 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  39.06 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.87 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  43.55 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  48.15 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  40 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  34.31 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  41.67 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  37.5 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  34.35 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  39.06 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  37.5 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.38 
 
 		 424 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  29.2 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  39.06 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  39.68 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  37.5 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  40.98 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  45.61 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  37.5 
 
 		 439 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  44.83 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  35 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  40 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  40.98 
 
 		 484 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 425 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  39.44 
 
 		 578 aa  43.9  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  34.92 
 
 		 431 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  35.82 
 
 		 428 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.13 
 
 		 425 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  38.81 
 
 		 428 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>