61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5934 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  70.27 
 
 		 561 aa  812    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  61.85 
 
 		 555 aa  681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  73.47 
 
 		 561 aa  857    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  57.67 
 
 		 556 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  72.56 
 
 		 561 aa  833    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 562 aa  1158    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  71.05 
 
 		 566 aa  817    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  70.64 
 
 		 566 aa  831    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  59.09 
 
 		 558 aa  685    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  55.53 
 
 		 549 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  46.61 
 
 		 572 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.82 
 
 		 542 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.77 
 
 		 548 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.68 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.26 
 
 		 548 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.87 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.06 
 
 		 543 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.87 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.68 
 
 		 543 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  40.54 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.89 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  36.06 
 
 		 583 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.79 
 
 		 567 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.14 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  35.7 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  37.43 
 
 		 567 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.25 
 
 		 567 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  38.04 
 
 		 567 aa  364  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  36.02 
 
 		 566 aa  360  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.21 
 
 		 584 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  37.33 
 
 		 565 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  36.62 
 
 		 566 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.66 
 
 		 570 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.94 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  38.52 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  37.57 
 
 		 568 aa  342  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  35.65 
 
 		 582 aa  340  5e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.52 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  37.73 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.1 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  36.8 
 
 		 578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.13 
 
 		 569 aa  329  8e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  37.87 
 
 		 570 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  36.84 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  42.62 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  41.27 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.34 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  39.13 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.62 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.98 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  38.81 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  33.61 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 		 425 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  41.38 
 
 		 497 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  43.33 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  43.28 
 
 		 572 aa  43.9  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  40.3 
 
 		 420 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  44.26 
 
 		 427 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.44 
 
 		 429 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>