79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5999 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  74.59 
 
 		 548 aa  818    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  74.22 
 
 		 548 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 543 aa  1085    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  74.22 
 
 		 548 aa  818    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  89.69 
 
 		 543 aa  980    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  74.41 
 
 		 548 aa  818    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.99 
 
 		 542 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  47.19 
 
 		 572 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.57 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.68 
 
 		 562 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.04 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.28 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.83 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.44 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.22 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  43.49 
 
 		 555 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  43.91 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.68 
 
 		 566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.97 
 
 		 552 aa  349  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  35.34 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.98 
 
 		 567 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  35.88 
 
 		 566 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  34.43 
 
 		 567 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.43 
 
 		 567 aa  312  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  35.24 
 
 		 570 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  35.71 
 
 		 578 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.93 
 
 		 570 aa  299  8e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  33.91 
 
 		 567 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.39 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  34.78 
 
 		 568 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.86 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 583 aa  286  8e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32 
 
 		 583 aa  286  9e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  34.29 
 
 		 568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.69 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 583 aa  280  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  32.73 
 
 		 565 aa  280  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  32.57 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  33.65 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  31.78 
 
 		 584 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.29 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  35.59 
 
 		 566 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.52 
 
 		 566 aa  259  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  31.33 
 
 		 597 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  41.54 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  39.06 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  44.64 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  39.06 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  48.28 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  30.32 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  43.75 
 
 		 439 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  47.37 
 
 		 489 aa  47.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  47.37 
 
 		 489 aa  47.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  39.06 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  39.06 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.67 
 
 		 422 aa  47.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  40.62 
 
 		 441 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.68 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.27 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.27 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  41.18 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.67 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.38 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  44.26 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  41.18 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  39.06 
 
 		 431 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  43.86 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  42.86 
 
 		 530 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  44.26 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  47.62 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  43.86 
 
 		 490 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  38.1 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 432 aa  44.3  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  25 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.33 
 
 		 425 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  45 
 
 		 425 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  26.29 
 
 		 471 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  32.81 
 
 		 428 aa  43.5  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  40.98 
 
 		 484 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>