155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1530 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  57.39 
 
 		 584 aa  710    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  58.76 
 
 		 584 aa  723    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  95.54 
 
 		 583 aa  1166    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  78.9 
 
 		 583 aa  990    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  58.01 
 
 		 597 aa  729    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  100 
 
 		 583 aa  1210    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  98.46 
 
 		 583 aa  1197    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  51.73 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  52.94 
 
 		 567 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  50.87 
 
 		 567 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  50.87 
 
 		 567 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  46.29 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  44.97 
 
 		 570 aa  522  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  47.06 
 
 		 568 aa  521  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  46.1 
 
 		 582 aa  520  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  45.69 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  43.66 
 
 		 566 aa  511  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  44.58 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  44.35 
 
 		 568 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.97 
 
 		 570 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.45 
 
 		 569 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.83 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  43.08 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  40.14 
 
 		 565 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.74 
 
 		 566 aa  463  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.55 
 
 		 558 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  37.65 
 
 		 555 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.04 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.06 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.06 
 
 		 562 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.4 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.84 
 
 		 561 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.51 
 
 		 561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.48 
 
 		 566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  35.33 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.19 
 
 		 561 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  30.86 
 
 		 572 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.12 
 
 		 542 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.63 
 
 		 548 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.74 
 
 		 543 aa  283  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.98 
 
 		 548 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.21 
 
 		 543 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.62 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.62 
 
 		 548 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  44.62 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.45 
 
 		 429 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.48 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  49.21 
 
 		 427 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  41.33 
 
 		 413 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  43.08 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  42.42 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  40 
 
 		 436 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  49.21 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  39.39 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.88 
 
 		 431 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  40 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  38.96 
 
 		 416 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  40.62 
 
 		 424 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  43.08 
 
 		 386 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.88 
 
 		 429 aa  51.6  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  41.33 
 
 		 534 aa  51.2  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  40 
 
 		 413 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.76 
 
 		 434 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 433 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 433 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.54 
 
 		 430 aa  50.8  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  40.62 
 
 		 427 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  44.44 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  38.75 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  37.84 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.28 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  46.03 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  45.45 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  34.33 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  37.66 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  37.33 
 
 		 420 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  36.11 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  36.76 
 
 		 420 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.76 
 
 		 429 aa  47  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.65 
 
 		 425 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  46.15 
 
 		 396 aa  47  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  36.11 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  45.16 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  39.06 
 
 		 522 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  40.3 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  34.29 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  32.53 
 
 		 408 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  36.92 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.81 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.46 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  35.9 
 
 		 479 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  35.71 
 
 		 475 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  37.5 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  31.58 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  37.18 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  37.04 
 
 		 413 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  32.35 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  29.49 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  42.62 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>