113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1097 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  100 
 
 
566 aa  1169    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  52.35 
 
 
566 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  47.86 
 
 
565 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  47.33 
 
 
566 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  49.18 
 
 
566 aa  551  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  46.11 
 
 
583 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  46.29 
 
 
583 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.13 
 
 
584 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  46.89 
 
 
568 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.11 
 
 
583 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  45.13 
 
 
570 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.77 
 
 
583 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.26 
 
 
569 aa  531  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  46.36 
 
 
567 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.65 
 
 
567 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.76 
 
 
570 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  45.74 
 
 
571 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.65 
 
 
567 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.35 
 
 
584 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  46.14 
 
 
567 aa  514  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  43.87 
 
 
568 aa  510  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.58 
 
 
570 aa  502  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  42.69 
 
 
597 aa  504  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  43.33 
 
 
582 aa  495  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  41.67 
 
 
578 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.35 
 
 
552 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.39 
 
 
558 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  39.71 
 
 
555 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.9 
 
 
556 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.22 
 
 
561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.2 
 
 
566 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.42 
 
 
561 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.54 
 
 
562 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.61 
 
 
566 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.2 
 
 
561 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  39.64 
 
 
549 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  36.71 
 
 
572 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.85 
 
 
548 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.3 
 
 
542 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.32 
 
 
548 aa  324  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.68 
 
 
548 aa  322  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.5 
 
 
548 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.34 
 
 
543 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.89 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.06 
 
 
425 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 
432 aa  57  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.06 
 
 
425 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  45.45 
 
 
422 aa  53.5  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  39.13 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  44.83 
 
 
434 aa  52.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  44.83 
 
 
434 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.65 
 
 
425 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  33.33 
 
 
426 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  38.27 
 
 
435 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  41.43 
 
 
436 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  41.77 
 
 
489 aa  50.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.18 
 
 
424 aa  50.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  44.3 
 
 
489 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  44.44 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  27.44 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  44.3 
 
 
489 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  43.21 
 
 
474 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  44.62 
 
 
425 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  41.03 
 
 
425 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  38.46 
 
 
427 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  39.13 
 
 
503 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  42.19 
 
 
385 aa  47.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  42.19 
 
 
385 aa  47.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  44.44 
 
 
572 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  45.16 
 
 
412 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  38.27 
 
 
472 aa  47  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  37.23 
 
 
471 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  41.27 
 
 
431 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  41.54 
 
 
577 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  42.86 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  53.49 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  47.54 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  42.86 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  38.46 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  37.14 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  39.76 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.27 
 
 
441 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  39.29 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  39.68 
 
 
417 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  42.42 
 
 
431 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.75 
 
 
425 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  31.03 
 
 
497 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  36.51 
 
 
414 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  31 
 
 
412 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 
429 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  37.5 
 
 
485 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  37.5 
 
 
485 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  38.67 
 
 
467 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  39.24 
 
 
484 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  42.86 
 
 
389 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  41.94 
 
 
475 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  35.71 
 
 
370 aa  44.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  27.44 
 
 
423 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.71 
 
 
424 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  47.62 
 
 
578 aa  44.3  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>