138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1662 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  56.28 
 
 		 584 aa  701    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  56.36 
 
 		 584 aa  711    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  79.25 
 
 		 583 aa  992    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  100 
 
 		 583 aa  1212    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  57.84 
 
 		 597 aa  722    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  78.9 
 
 		 583 aa  990    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  78.22 
 
 		 583 aa  988    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  49.05 
 
 		 567 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  48.01 
 
 		 567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.01 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  49.91 
 
 		 567 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  46.11 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  45.41 
 
 		 566 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  45.21 
 
 		 582 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.66 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  43.76 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  45.07 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  43.59 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  44.22 
 
 		 578 aa  497  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  44.48 
 
 		 571 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.91 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.29 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  43.06 
 
 		 566 aa  485  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  39.62 
 
 		 565 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.29 
 
 		 566 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.19 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.2 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  37.26 
 
 		 555 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.52 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.7 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.97 
 
 		 561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.61 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.62 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 549 aa  336  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.33 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.46 
 
 		 566 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  32.43 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.56 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.26 
 
 		 543 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.25 
 
 		 548 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.69 
 
 		 548 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.26 
 
 		 543 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.52 
 
 		 548 aa  266  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.52 
 
 		 548 aa  266  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  42.42 
 
 		 386 aa  54.7  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 		 429 aa  54.3  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 429 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  44.44 
 
 		 433 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  41.89 
 
 		 413 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  39.19 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  40.32 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  46.03 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  43.75 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  36.84 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  38.27 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  42.19 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 433 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 433 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  40.54 
 
 		 405 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  35.82 
 
 		 420 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  40.54 
 
 		 413 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  36.73 
 
 		 417 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  36.51 
 
 		 425 aa  50.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  34.92 
 
 		 431 aa  50.4  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  31.82 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  43.75 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  39.19 
 
 		 413 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  41.27 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  39.34 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.46 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  37.66 
 
 		 416 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  42.42 
 
 		 577 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  42.19 
 
 		 435 aa  48.5  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 425 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  29.79 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  36.07 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  37.84 
 
 		 420 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  42.86 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  39.73 
 
 		 586 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.06 
 
 		 428 aa  47.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  36.51 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.89 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  42.19 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  41.54 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  43.55 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  34.52 
 
 		 396 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  37.68 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  39.73 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  38.81 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  46.34 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  35.38 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  35.82 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  39.39 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.34 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  36 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  41.54 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>