111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1989 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  65.91 
 
 		 566 aa  789    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  100 
 
 		 571 aa  1186    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  63.4 
 
 		 570 aa  727    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  66.84 
 
 		 570 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  65.61 
 
 		 568 aa  781    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  64.15 
 
 		 568 aa  763    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  67.19 
 
 		 578 aa  806    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  68.01 
 
 		 569 aa  831    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  65.56 
 
 		 570 aa  787    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  52.8 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  52.8 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  52.8 
 
 		 567 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  52.62 
 
 		 567 aa  566  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  45.74 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  45.69 
 
 		 583 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  46.88 
 
 		 566 aa  510  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.19 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.69 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  45.6 
 
 		 565 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  47.23 
 
 		 582 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  44.48 
 
 		 583 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.27 
 
 		 584 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.49 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  42.83 
 
 		 597 aa  476  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.51 
 
 		 566 aa  465  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.5 
 
 		 566 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.21 
 
 		 558 aa  356  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.92 
 
 		 552 aa  356  5.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  37.74 
 
 		 555 aa  349  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.5 
 
 		 566 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.41 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.83 
 
 		 561 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.52 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.98 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.69 
 
 		 561 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  37.84 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  31.88 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.35 
 
 		 542 aa  293  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.8 
 
 		 548 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.57 
 
 		 543 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.5 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.14 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.67 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.84 
 
 		 548 aa  263  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  44.59 
 
 		 534 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  40.7 
 
 		 479 aa  54.3  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.78 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  41.18 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 429 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  46.15 
 
 		 395 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  46.75 
 
 		 590 aa  50.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  43.75 
 
 		 425 aa  50.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  48.48 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.88 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  38.16 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  29.73 
 
 		 481 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  40.62 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  37.5 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  36.78 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.91 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  39.39 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  40.32 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  41.79 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.28 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  40.3 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  46.97 
 
 		 579 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  32.38 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 425 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  45.45 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.33 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  37.5 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  43.75 
 
 		 578 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  39.74 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  33.33 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  36.49 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  38.24 
 
 		 408 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  43.94 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.88 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  33.33 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  42.67 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  44.44 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  39.71 
 
 		 474 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  34.65 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  43.75 
 
 		 581 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  35.29 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  40.62 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  41.54 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.71 
 
 		 433 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  38.24 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.76 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  28.44 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  30.19 
 
 		 486 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  41.3 
 
 		 467 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  43.75 
 
 		 583 aa  44.3  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  40 
 
 		 530 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  44.12 
 
 		 436 aa  44.3  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  33.64 
 
 		 481 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  40.58 
 
 		 460 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  38.24 
 
 		 405 aa  44.3  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  39.73 
 
 		 586 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>