66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0371 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  66.78 
 
 		 570 aa  803    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  68.13 
 
 		 569 aa  833    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  67.37 
 
 		 568 aa  822    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  100 
 
 		 570 aa  1188    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  61.71 
 
 		 570 aa  712    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  66.73 
 
 		 578 aa  796    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  63.73 
 
 		 566 aa  775    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  66.84 
 
 		 571 aa  833    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  66.84 
 
 		 568 aa  795    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  50.09 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  50.17 
 
 		 567 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  50.35 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  50.26 
 
 		 567 aa  551  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  45.13 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  44.97 
 
 		 583 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.63 
 
 		 583 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.63 
 
 		 583 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  43.76 
 
 		 583 aa  501  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  45.04 
 
 		 566 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.05 
 
 		 584 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.49 
 
 		 584 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  43.86 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  43.58 
 
 		 582 aa  475  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.43 
 
 		 566 aa  457  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  39.03 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.23 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.78 
 
 		 558 aa  347  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.57 
 
 		 561 aa  345  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.15 
 
 		 566 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.56 
 
 		 556 aa  342  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.12 
 
 		 561 aa  340  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  36.02 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.93 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  34.51 
 
 		 572 aa  329  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.87 
 
 		 562 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.96 
 
 		 566 aa  327  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.3 
 
 		 542 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  36.53 
 
 		 549 aa  312  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.83 
 
 		 548 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.24 
 
 		 543 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.35 
 
 		 548 aa  297  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.99 
 
 		 548 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.99 
 
 		 548 aa  294  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.17 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  39.39 
 
 		 481 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  42.19 
 
 		 431 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.45 
 
 		 425 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  43.75 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  45.9 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  28.47 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  41.94 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  37.97 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  34.67 
 
 		 570 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  35.53 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  42.19 
 
 		 417 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  46.97 
 
 		 407 aa  44.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  35.62 
 
 		 411 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  36.49 
 
 		 436 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  34.12 
 
 		 462 aa  44.3  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  36.46 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  39.39 
 
 		 587 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 424 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0057  urease subunit alpha  32.91 
 
 		 571 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 424 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  32.43 
 
 		 461 aa  43.5  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>